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Enregistrement W2008607322 · doi:10.1073/pnas.0911855107

Toward discovery science of human brain function

2010· article· en· W2008607322 sur OpenAlexaff
Bharat B. Biswal, Maarten Mennes, Xi‐Nian Zuo, Suril Gohel, Clare Kelly, Christian F. Beckmann, Jonathan S. Adelstein, Randy L. Buckner, Stan Colcombe, Anne-Marie Dogonowski, Monique Ernst, Damien A. Fair, Michelle Hampson, Matthew J. Hoptman, James S. Hyde, Vesa Kiviniemi, Rolf Kötter, Shi‐Jiang Li, Ching‐Po Lin, Mark J. Lowe, Clare E. Mackay, David J. Madden, Kristoffer H. Madsen, Daniel S. Margulies, Helen S. Mayberg, Katie L. McMahon, Christopher S. Monk, Stewart H. Mostofsky, Bonnie J. Nagel, James J. Pekar, Scott Peltier, Steven E. Petersen, Valentin Riedl, Serge A.R.B. Rombouts, Bart Rypma, Bradley L. Schlaggar, Sein Schmidt, Rachael D. Seidler, Greg J. Siegle, Christian Sorg, Gao‐Jun Teng, Juha Veijola, Arno Villringer, Martin Walter, Lihong Wang, Susan Whitfield‐Gabrieli, Peter Williamson, Christian Windischberger, Yu‐Feng Zang, Hong-Ying Zhang, F. Xavier Castellanos, Michael P. Milham

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesHoward Hughes Medical InstituteNational Institute on Drug AbuseNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental Health
Mots-clésHuman Connectome ProjectConnectomeNeuroimagingFunctional connectivityResting state fMRINeuroscienceConnectomicsDrug discoveryFunctional neuroimagingBrain functionBiologyPsychologyComputer scienceBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although it is being successfully implemented for exploration of the genome, discovery science has eluded the functional neuroimaging community. The core challenge remains the development of common paradigms for interrogating the myriad functional systems in the brain without the constraints of a priori hypotheses. Resting-state functional MRI (R-fMRI) constitutes a candidate approach capable of addressing this challenge. Imaging the brain during rest reveals large-amplitude spontaneous low-frequency (<0.1 Hz) fluctuations in the fMRI signal that are temporally correlated across functionally related areas. Referred to as functional connectivity, these correlations yield detailed maps of complex neural systems, collectively constituting an individual's "functional connectome." Reproducibility across datasets and individuals suggests the functional connectome has a common architecture, yet each individual's functional connectome exhibits unique features, with stable, meaningful interindividual differences in connectivity patterns and strengths. Comprehensive mapping of the functional connectome, and its subsequent exploitation to discern genetic influences and brain-behavior relationships, will require multicenter collaborative datasets. Here we initiate this endeavor by gathering R-fMRI data from 1,414 volunteers collected independently at 35 international centers. We demonstrate a universal architecture of positive and negative functional connections, as well as consistent loci of inter-individual variability. Age and sex emerged as significant determinants. These results demonstrate that independent R-fMRI datasets can be aggregated and shared. High-throughput R-fMRI can provide quantitative phenotypes for molecular genetic studies and biomarkers of developmental and pathological processes in the brain. To initiate discovery science of brain function, the 1000 Functional Connectomes Project dataset is freely accessible at www.nitrc.org/projects/fcon_1000/.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,028
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,067

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,028
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0010,009
Communication savante0,0050,011
Science ouverte0,0020,005
Intégrité de la recherche0,0030,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3 093
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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