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Enregistrement W2144718749 · doi:10.1136/jcp.2008.057257

Retracted: Immunohistochemical prognostic markers in diffuse large B-cell lymphoma: validation of tissue microarray as a prerequisite for broad clinical applications (a study from the Lunenburg Lymphoma Biomarker Consortium)

2008· article· en· W2144718749 sur OpenAlexaff
Daphne de Jong, Wanling Xie, Andreas Rosenwald, Mukesh Chhanabhai, Philippe Gaulard, W. Klapper, Alexander Lee, Birgitta Sander, Christoph Thorns, Elı́as Campo, Thierry Jo Molina, Anton Hagenbeek, Sandra J. Horning, Andrew Lister, John Raemaekers, Gilles Salles, Randy D. Gascoyne, Edie Weller

Dossier post-publication

NatureRetraction
MotifDuplication of Data;Duplication of Text;Concerns/Issues about Referencing/Attributions;
Date8/28/2012 0:00
Signalé par OpenAlex ?Oui

Source : Retraction Watch, jointe par DOI. OpenAlex consigne la rétractation dans is_retracted, un booléen sur un espace d'états à au moins quatre valeurs ; il ne peut donc exprimer ni une expression de préoccupation, ni une correction, ni un rétablissement, et les rapporte comme false, ce qui se lit comme « rien à signaler ».

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Pathology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesTakeda OncologyGenentechNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésConcordanceImmunohistochemistryTissue microarrayPathologyLymphomaDiffuse large B-cell lymphomaMedicineOncologyBiomarkerInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND AIMS: The results of class prediction and the determination of prognostic markers in diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) have been variably reported. Apart from biological variations, this may be caused by differences in laboratory techniques, scoring definitions and inter- and intra-observer variation. In this study, an international collaboration of clinical lymphoma research groups has concentrated on validation and standardisation of immunohistochemistry of the currently potentially interesting prognostic markers in DLBCL. METHODS: Sections of a tissue microarray with 36 cases of DLBCL were stained in eight laboratories with antibodies to CD20, CD5, bcl-2, bcl-6, CD10, HLA-DR, MUM-1 and Ki-67 according to local methods. The study was performed in two rounds, firstly focused on the evaluation of laboratory staining variation, and secondly on the scoring variation. RESULTS: Different techniques resulted in highly variable results and poor reproducibility for almost all markers. Reproducibility of the nuclear markers was highly sensitive to technical variations, including immunological enhancement techniques (agreements 34%). With elimination of variation due to staining and uniformly agreed on scoring criteria, significant improvement was seen; however less so for bcl-6 and Ki-67 (agreement 53-58%). Absence of internal controls that preclude scoring, significantly influenced the results for CD10 and bcl-6. CONCLUSION: Semi-quantitative immunohistochemistry for subclassification of DLBCL is feasible, but with varying rates of concordance for different markers and only using optimised techniques and strict scoring criteria. These findings may explain the wide variation in prognostic impact reported in the literature. Harmonisation of techniques and centralised consensus review appears mandatory when using immunohistochemical biomarkers for treatment stratification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,049
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,092
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,994
Score d'incertitude au seuil0,259

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0490,092
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0040,001
Intégrité de la recherche0,0060,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,391
Écart entre enseignants0,339 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations169
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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