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Enregistrement W2171126674 · doi:10.1152/ajpcell.00284.2012

Calcium-binding protein 39 facilitates molecular interaction between Ste20p proline alanine-rich kinase and oxidative stress response 1 monomers

2012· article· en· W2171126674 sur OpenAlexaff
José Ponce‐Coria, Kenneth B. Gagnon, Eric Delpire

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Cell Physiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésKinaseAlanineProtein kinase domainChemistryBiochemistryDimerSerineMonomerMutantPhosphorylationProtein kinase ACell biologyWild typeProtein subunitAmino acidBiologyGene

Résumé

X-ray crystallography of the catalytic domain of oxidative stress response 1 (OSR1) has provided evidence for dimerization and domain swapping. However, the functional significance of dimer formation or domain swapping has yet to be addressed. In this study, we used nine glutamine residues to link the carboxyl end of one SPAK (related Ste20 kinase) monomer to the amino end of another SPAK monomer to assess the role of kinase monomers versus dimers in Na-K-2Cl cotransporter 1 (NKCC1) activation. Transport studies in Xenopus laevis oocytes show that forcing dimerization of two wild-type SPAK molecules results in cotransporter activation when calcium-binding protein 39 (Cab39) is coexpressed, indicating that the presence of Cab39 can bypass the upstream phosphorylation requirement of SPAK normally associated with kinase activation. We determined that monomers are the functional units of the kinase as concatamers consisting of an active and various inactive monomers were still functional. Furthermore, we found that two different nonfunctional SPAK mutants could be linked together in a concatamer and activated, presumably by domain swapping, indicating that dimerization and domain swapping are both important components of kinase activation. Finally, we demonstrate rescue of a nonfunctional SPAK mutant by domain swapping with wild-type OSR1, indicating that heterodimers of the two Ste20-related kinases are possible and therefore potentially relevant to the regulation of NKCC1 activity.

Conservé avec la notice de tri, où il sert de preuve aux étiquettes ci-dessus.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Le tri à trois modèles

les 5 600 travaux triés →

Les trois modèles l'ont jugé hors champ.

strate : aff_core · poids de sondage : 5595.24 (l'échantillon est stratifié ; tout taux calculé sans le poids est faux)
Claude Opus 4.8OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

Biochemistry study of calcium-binding protein 39 and SPAK kinase dimerization; molecular signalling.

GPT-5.6 (high)OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

It investigates molecular kinase interactions, not research itself.

Grok 4.5OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

Molecular cell biology of SPAK/OSR1 kinase dimers and Cab39; domain biochemistry.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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