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Substrate-Specific Differential Gene Expression and RNA Editing in the Brown Rot Fungus Fomitopsis pinicola

2018· article· en· 40 citations· W2806892099 sur OpenAlex· 10.1128/aem.00991-18

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Dossier post-publication

Nature
Retraction
Motif
Error in Analyses;Error in Results and/or Conclusions;Retract and Replace;
Date
7/27/2021 0:00
Signalé par OpenAlex ?
Oui

Source : Retraction Watch, jointe par DOI. OpenAlex consigne la rétractation dans is_retracted, un booléen sur un espace d'états à au moins quatre valeurs ; il ne peut donc exprimer ni une expression de préoccupation, ni une correction, ni un rétablissement, et les rapporte comme false, ce qui se lit comme « rien à signaler ».

Résumé

All species of wood-decaying fungi occur on a characteristic range of substrates (host plants), which may be broad or narrow. Understanding the mechanisms that enable fungi to grow on particular substrates is important for both fungal ecology and applied uses of different feedstocks in industrial processes. We grew the wood-decaying polypore Fomitopsis pinicola on three different wood species, aspen, pine, and spruce, under various culture conditions. We examined both gene expression (transcription levels) and RNA editing (posttranscriptional modification of RNA, which can potentially yield different proteins from the same gene). We found that F. pinicola is able to modify both gene expression and RNA editing profiles across different substrate species and culture conditions. Many of the genes involved encode enzymes with known or predicted functions in wood decay. This work provides clues to how wood-decaying fungi may adjust their arsenal of decay enzymes to accommodate different host substrates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
Applied and Environmental Microbiology
Thématique
CRISPR and Genetic Engineering
Domaine
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens
University of Toronto
Organismes subventionnaires
National Science Foundation
Mots-clés
GeneGene expressionFungusBiologyRNATranscription (linguistics)BotanyGenetics
Résumé présent dans OpenAlex
oui