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Enregistrement W2899951262 · doi:10.1038/s41598-018-35044-9

Performance of Deep Learning Architectures and Transfer Learning for Detecting Glaucomatous Optic Neuropathy in Fundus Photographs

2018· article· en· W2899951262 sur OpenAlexfundno aff
Mark Christopher, Akram Belghith, Christopher Bowd, James A. Proudfoot, Michael H. Goldbaum, Robert N. Weinreb, Christopher A. Girkin, Jeffrey M. Liebmann, Linda M. Zangwill

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRetinal Imaging and Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteGenentechHeidelberg EngineeringAerie PharmaceuticalsValeant Pharmaceuticals InternationalCarl Zeiss Meditec AGAllerganResearch to Prevent BlindnessEyeSight Foundation of Alabama
Mots-clésFundus (uterus)Transfer of learningOptic neuropathyComputer scienceOphthalmologyGlaucomaDeep learningOptometryOptic nerveArtificial intelligenceMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ability of deep learning architectures to identify glaucomatous optic neuropathy (GON) in fundus photographs was evaluated. A large database of fundus photographs (n = 14,822) from a racially and ethnically diverse group of individuals (over 33% of African descent) was evaluated by expert reviewers and classified as GON or healthy. Several deep learning architectures and the impact of transfer learning were evaluated. The best performing model achieved an overall area under receiver operating characteristic (AUC) of 0.91 in distinguishing GON eyes from healthy eyes. It also achieved an AUC of 0.97 for identifying GON eyes with moderate-to-severe functional loss and 0.89 for GON eyes with mild functional loss. A sensitivity of 88% at a set 95% specificity was achieved in detecting moderate-to-severe GON. In all cases, transfer improved performance and reduced training time. Model visualizations indicate that these deep learning models relied on, in part, anatomical features in the inferior and superior regions of the optic disc, areas commonly used by clinicians to diagnose GON. The results suggest that deep learning-based assessment of fundus images could be useful in clinical decision support systems and in the automation of large-scale glaucoma detection and screening programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations330
Publié2018
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Résumé présentoui

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