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Enregistrement W6939608208 · doi:10.6084/m9.figshare.26426298.v1

Causal effects of genetically determined blood metabolites on asthma: a bidirectional Mendelian randomization study

2024· dataset· en· W6939608208 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2024
Typedataset
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMendelian randomizationMetaboliteMetabolomicsGenome-wide association studyPleiotropyGenetic associationMetabolomeAsthmaObservational study

Résumé

The observational association between blood metabolites and asthma has been extensively studied. However, it is still unclear whether this association is causal. In this study, we aimed to investigate the causal relationship between blood metabolites and asthma using a bidirectional Mendelian randomization (MR) analysis. Additionally, we aimed to explore the potential mechanisms underlying this relationship. The study design involved the use of genetic instruments as instrumental variables (IVs) to fulfill the assumptions of MR analysis. The data on 1,091 metabolites and 309 metabolite ratios were obtained from the Canadian Longitudinal Study on Aging (CLSA), while the data on asthma were obtained from the Integrative Epidemiology Unit (IEU) Open GWAS Project. Utilizing the inverse variance-weighted (IVW) method as the primary MR analysis approach, sensitivity tests were conducted to assess the reliability of the findings, which involved employing Cochran’s Q and the MR-Egger intercept. Furthermore, Bayesian weighted MR was used to further test the robustness of the results. Additionally, pathway analysis was conducted to explore the metabolic explanations underlying asthma. In our study, a comprehensive MR Analysis identified 10 metabolites and 6 metabolite ratios significantly associated with the development of asthma (FDR &lt; 0.05). The metabolites included glycerophosphocholines(GPCs), glycerophosphoethanolamines(GPEs), and an unknown metabolite. Of these, 1-arachidonoyl-GPC, 1-myristoyl-2-arachidonoyl-GPC, 1-palmitoyl-2-arachidonoyl-GPC, and 1-(1-enyl-palmitoyl)-2-arachidonoyl-GPC were associated with an increased risk of asthma, whereas 1,2-dilinoleoyl-GPC, 1-palmitoyl-2-linoleoyl-GPC, 1,2-dilinoleoyl-GPE, 1 − oleoyl − 2 − linoleoyl − GPE, 1-palmitoyl-2-linoleoyl-GPE, and X-21470 were found to have a protective effect. No heterogeneity and pleiotropy were observed in the significant metabolites (<i>p</i> &gt; 0.05), and each metabolite exhibited a consistent effect direction across all five methods. BWMR analysis results confirmed the significance and direction of effects across exposures, except for Cholesterol to linoleoyl-arachidonoyl-glycerol ratio(<i>p</i> = 0.673). Pathway analysis suggests that glycerophospholipid metabolism may potentially be a mechanism underlying the development of asthma. Our MR findings suggest that the identified metabolites and pathways can serve as biomarkers for clinical asthma screening and prevention, while also providing new insights for future mechanistic exploration and drug target selection.

Conservé avec la notice de tri, où il sert de preuve aux étiquettes ci-dessus.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Le tri à trois modèles

les 5 600 travaux triés →

Les trois modèles l'ont jugé hors champ.

strate : about_only · poids de sondage : 3321.24 (l'échantillon est stratifié ; tout taux calculé sans le poids est faux)
Claude Opus 4.8OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

Mendelian randomization study of blood metabolites and asthma; a method is used to answer a biomedical question, not studied.

GPT-5.6 (high)OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

It uses Mendelian randomization to study asthma biology, not research practice.

Grok 4.5OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

Bidirectional MR of blood metabolites and asthma is domain biomedical etiology, not a study of research practice.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,021
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,037
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0210,037
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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