Notice bibliographique
Résumé
The term “RNA editing” was first coined more than a decade ago to describe the phenomenon of uridine insertion into trypanosomatid mitochondrial transcripts. Unlike mRNAs, transcripts of tRNA and rRNA genes are themselves converted into the functional entities they encode. RNA editing events represent additional steps in posttranscriptional processing and, like nucleoside modifications, they may occur at different stages in the pathway. To quantify RNA editing one usually compares the intensity of the bands on a sequencing (or primer extension) ladder that correspond to the edited and unedited versions of the RNA. The first example of tRNA editing in a mitochondrial (mt) system is that reported to occur in the ameboid protozoon Acantbamoeba castellanii. The observed nucleotide substitutions consisted of both purine-to-purine and pyrimidine- to-purine changes, suggesting a mechanism involving base or nucleotide replacement. More recently, it has been shown that nascent mRNAs present in stalled RNA polymerase complexes are substrates for editing by both cytidine and dinucleotide insertion. In a particular study the isolated RNAs were found to be edited to within 14 to 22 nucleotides of the stalled polymerase, suggesting that the insertional editing activity in Physarum is able to act quite close to the site of RNA synthesis. The most recently described mode of tRNA editing is that found in the mitochondria of metazoa.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,007 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».