Do All Hemochromatosis Patients Have the Same Origin? A Pilot Study of Mitochondrial DNA and Y-DNA
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Mitochondrial DNA (mtDNA) and Y-DNA analysis have been widely used to predict ancestral origin. Genetic anthropologists predict that human civilizations may have originated in central Africa one to two million years previously. Primary iron overload is not a common diagnosis among indigenous people of northern Africa, but hereditary hemochromatosis is present in approximately one in 200 people in northern Europe. MtDNA analysis has the potential to determine whether contemporary hemochromatosis patients have an ancient ancestral linkage. METHODS: DNA was obtained from buccal smears for mtDNA and Y-DNA analysis. Y-DNA analysis included examination of 20 short tandem repeat markers on the Y chromosome. Analysis of mtDNA involved sequencing of the HVR-1 genetic sequence (nucleotides 16001 to 16520) and was compared with the Cambridge Reference Sequence. MtDNA ancestral haplotypes were predicted from the analysis of the HVR-1 sequence. RESULTS: Twenty-six male C282Y homozygotes were studied. There were 28 polymorphisms present in the HVR-1 sequence of these participants. The most common polymorphism was present at position 16519 in 15 participants and at position 16311 in eight participants. There were 12 different ancestral haplotypes predicted by mtDNA analysis, with the K haplotype being present in five participants. Y-DNA analysis revealed eight different haplotypes, with R1b being found in 11 of the 26 participants. CONCLUSION: Analysis of mtDNA and Y-DNA in 26 hemochromatosis patients suggested that they did not all originate from the same ancestral tribe in Africa. These findings were consistent with the theory that the original hemochromatosis mutation occurred after migration of these ancestral people to central Europe, possibly 4000 years previously.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».