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Enregistrement W1010833643 · doi:10.1038/srep10642

Tight junction CLDN2 gene is a direct target of the vitamin D receptor

2015· article· en· W1010833643 sur OpenAlexaff
Yong-guo Zhang, Shaoping Wu, Rong Lu, David Zhou, Jingsong Zhou, Geert Carmeliet, Elaine O. Petrof, Erika C. Claud, Jun Sun

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesSwim Across America
Mots-clésCalcitriol receptorTranscription factorBiologyClaudinCell biologyMolecular biologyTight junctionReceptorCancer researchGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The breakdown of the intestinal barrier is a common manifestation of many diseases. Recent evidence suggests that vitamin D and its receptor VDR may regulate intestinal barrier function. Claudin-2 is a tight junction protein that mediates paracellular water transport in intestinal epithelia, rendering them "leaky". Using whole body VDR(-/-) mice, intestinal epithelial VDR conditional knockout (VDR(ΔIEC)) mice, and cultured human intestinal epithelial cells, we demonstrate here that the CLDN2 gene is a direct target of the transcription factor VDR. The Caudal-Related Homeobox (Cdx) protein family is a group of the transcription factor proteins which bind to DNA to regulate the expression of genes. Our data showed that VDR-enhances Claudin-2 promoter activity in a Cdx1 binding site-dependent manner. We further identify a functional vitamin D response element (VDRE) 5΄-AGATAACAAAGGTCA-3΄ in the Cdx1 site of the Claudin-2 promoter. It is a VDRE required for the regulation of Claudin-2 by vitamin D. Absence of VDR decreased Claudin-2 expression by abolishing VDR/promoter binding. In vivo, VDR deletion in intestinal epithelial cells led to significant decreased Claudin-2 in VDR(-/-) and VDR(ΔIEC) mice. The current study reveals an important and novel mechanism for VDR by regulation of epithelial barriers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,173
Score d'incertitude au seuil0,244

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations134
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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