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Enregistrement W1013608422 · doi:10.1371/journal.ppat.1005092

Basic Prion Science “Spreads” Insight

2015· article· en· W1013608422 sur OpenAlexaff
David Westaway

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBiotechnology and Related Fields
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputational biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Translational research used to be fun.In fact, it used to be arresting-of course, considered here in the frame of triplets and ribonucleic acids of the transfer and mRNA variety.In fact, the mind-boggling concept that someone could actually know the velocity of a ribosome trundling down a messenger RNA, like a freight car on a railway track, led me to decide at a tender age that biochemistry was the only way to go.On a journey that included a compressed but vigorous stint in Switzerland ("molecular biology boot camp") and postdoctoral training with an eminent retrovirologist, my budding scientific life stood at a crossroads.What to do next?At this point, I had a reconnection with a moment from the past, in which a second-year, undergraduate version of myself read about an infectious agent called scrapie that didn't have a nucleic acid genome-bizarre!A serendipitous meeting, and this loose end was closed off; several productive research years were spent studying prions in San Francisco.Fast-forwarding through the nineties and noughties, we come to today's world, where the N in GANTT doesn't mean an ambiguous nucleotide but might mean that a progress report needs filing.For most basic biomedical scientists, the drone of the Translational Research mantra to leverage and commercialize can no longer be ignored; that ideology is enacted.The perception that taxpayers are being given value for money is the key driver in this equation, but how best to travel from a research lab environment to a Point A of a deep insight and thence, perhaps, to Point B of a significant impact upon delivered health care or a Point C of a commercialized platform technology?Perhaps the crux of the dilemma arises from a confusion of expectations and disciplines by politicians.Research and development (R&D) has predictability, a linear trajectory, and short timelines but may offer only shallow insights.R&D is certainly the logical option if one assumes that everything that can be discovered has already been discovered.On the other hand, basic research assumes that the catalog of ground rules for phenomena in the natural world is still being written; it has risk, as it lacks predictability and linearity.A benefit of basic research is that it routinely supplies a rigorous training environment.A yet bigger benefitalbeit less frequent-is that it provides "transformative" insights that can satisfy all expectations and deliverables.However, basic science can suffer from a variation on the theme of giving tax-payers value for money; namely, if the lay public or a Congressman (or, in Canada, a Member of Parliament) can't understand the project, then they are not satisfied, period-the initiative is deemed wasteful/weird/esoteric and a negative message is directed to the controllers of the research agency.Prion research has had a profound and lasting impact upon Biology-with-a-capital-B and illustrates these principles with its own trajectory-a trajectory that probably would not have been funded in a purely translational world.The molecular biology of these diseases emerged from the study of an arcane sheep infection that was more agricultural nuisance than life

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,048

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,006
Communication savante0,0030,007
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0030,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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