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Enregistrement W101398501

Role of human papillomavirus in the clinical and histopathologic features of laryngeal and hypopharyngeal cancers.

2009· article· en· W101398501 sur OpenAlexaboutno aff
Gülendam Bozdayı, Yusuf Kemal Kemaloğlu, Özgür Ekinci, Bora Doğan, Mustafa İlhan, Utku Aydíl, Gülen Akyol, Ahmet Köybaşıoğlu, Erdoğan İnal, Seyyal Rota

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPolymerase chain reactionHPV infectionBiologyHuman papillomavirusAmpliconDNA extractionPathologyOncologyMedicineMolecular biologyInternal medicineCancerGeneGeneticsCervical cancer
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: In this study, we aimed to evaluate the role of human papillomavirus (HPV) in the clinical and histopathologic features of laryngeal and hypopharyngeal cancers. METHOD: Paraffin wax-embedded sections consisting of 89 laryngeal and hypopharyngeal cancers from 210 patients were analyzed. Tissue samples were amplified by using a glucose 6-phosphatase dehydrogenase (G6PDH) control kit (Eurogentec, Seraing, Belgium), and G6PDH-positive samples were thought to have appropriate tissues by using a deoxyribonucleic acid (DNA) extraction kit (DNA mini kit, Qiagen, Germany). HPV and HPV-16 were detected by real-time polymerase chain reaction (PCR) using the L1 region. Real-time nested amplifications of MY09/11 products were done by GP5+/GP6+ primers and a cyanine-5-labeled HPV-16 DNA-specific probe. HPV-16-negative MY09/11 amplicons were sequenced by an OpenGene automated DNA sequencing system, and a similar percentage of sequences was calculated by GeneObjects software (Visible Genetics, Canada). RESULTS: Specimens from 89 subjects fitting the criteria were taken for PCR assay, and the HPV genome was analyzed in 65 cases because the remaining cases did not have enough tissue according to G6PDH amplification. HPV was positive in 27 cases (41.5%). HPV positivity was found to be associated with lymph node metastasis (LNM). Odds ratio analysis indicated that HPV positivity was an important factor for LNM but not for other parameters. CONCLUSIONS: HPV-16 infection can be associated with laryngeal carcinomas without LNM. Analysis of HPV positivity could be used as a prognostic factor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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