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Enregistrement W1016955318 · doi:10.1167/iovs.15-17104

Genotype and Phenotype Studies in Autosomal Dominant Retinitis Pigmentosa (adRP) of the French Canadian Founder Population

2015· article· en· W1016955318 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueInvestigative Ophthalmology & Visual Science · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGeneticsBiologyFounder effectSanger sequencingRetinitis pigmentosaLocus heterogeneityMissense mutationPopulationMutationPhenotypeGenetic heterogeneityGenotypeGeneHaplotypeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The French Canadian population of Quebec is a unique, well-known founder population with religious, linguistic, and geographic isolation. The genetics of retinitis pigmentosa (RP) in Quebec is not well studied thus far. The purpose of our study was to establish the genetic architecture of autosomal dominant RP (adRP) and to characterize the phenotypes associated with new adRP mutations in Quebec. METHODS: Sanger sequencing of the commonly mutated currently known adRP genes was performed in a clinically well-characterized cohort of 60 adRP French Canadian families. Phenotypes were analyzed by projected visual acuity (best corrected), Goldmann visual fields, optical coherence tomography (OCT), fundus autofluorescence (FAF), and ERG. The potential effect of the novel mutations was assessed using in silico bioinformatic tools. The pathogenicity of all variants was then confirmed by segregation analysis within the families, when available. RESULTS: We identified the causal mutation/gene in 24 of our adRP families, as 24 (40%) of 60 patients had adRP mutations in six known adRP genes. Eleven (46%) of these mutations were in RHO, four mutations (17%) were found in SNRNP200, three mutations (12.5%) in PRPH2/RDS, three mutations (12.5%) in TOPORS, two mutations (8%) in PRPF31, and one mutation (4%) in IMPDH1. Four mutations were novel. We identified new mutations in RHO (p.S270I), PRPF31 (p.R288W), IMPDH1 (p.Q318H), and TOPORS (p.H889R); the rest were previously reported. We present the genotype-phenotype characteristics of the four novel missense mutations. CONCLUSIONS: This is the first large screening of adRP genes in the founder population of Quebec. Our prevalence of known adRP genes is 40% in the French Canadian population, which is lower than in other adRP populations around the world, illustrating the uniqueness of the French Canadian population. Our findings are crucial in expanding the current understanding of the genotypic-phenotypic spectrum of RP and documenting the genetic architecture of our founder population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,192
Score d'incertitude au seuil0,989

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle