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Enregistrement W101941943 · doi:10.1096/fasebj.21.5.a196-a

Mutational analysis of polar amino acid residues within predicted transmembrane helices of Multidrug Resistance Protein 1 (ABCC1): Effect on substrate specificity

2007· article· en· W101941943 sur OpenAlexaff
Dawei Zhang, Susan P.C. Cole, Roger G. Deeley

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésABCC1Transmembrane domainATP-binding cassette transporterTransmembrane proteinContext (archaeology)ChemistryMutagenesisBiochemistryTransport proteinMultiple drug resistanceAmino acidTransporterBiophysicsBiologyMutationGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human Multidrug Resistance Protein1 (MRP1) is an ATP Binding Cassette (ABC) transporter that confers resistance to many natural product chemotherapeutic agents and can transport structurally diverse conjugated organic anions. In addition to two cytoplasmic nucleotide binding domains (NBDs), MRP1 has three polytopic membrane‐spanning domains (MSDs) with a total of 17 transmembrane (TM) helices. Using site‐directed mutagenesis, we demonstrated that certain polar residues within a number of TM helices are determinants of MRP1 substrate specificity or overall activity. For example, mutations T550A and T556A in TM10, N597A and S605A in TM11, E1089Q and K1092 in TM14, as well as Y1236F and T1241A in TM17 only modulated the drug resistance profile of MRP1. In contrast, Y568A in TM10, S1097A and N1100A in TM14, as well as T1242A in TM17 only altered the ability of MRP1 to transport the conjugated organic anion, 17β‐estradiol 17‐(β‐D‐glucuronide) (E 2 17βG). On the other hand, some mutations, such as N590A in TM11, D1084N in TM14, and Y1243F in TM17 affected overall activity of the protein. The location of these functionally important residues in TM helices will be discussed in the context of an energy‐minimized model of the membrane‐spanning domains of MRP1 in the presentation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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