Identification and characterization of copper-responsive proteins in arabidopsis
Notice bibliographique
Résumé
For the successful development of a hyperaccumulating plant sufficient for use in phytoremediation strategies, a thorough understanding of the mechanism of hyperaccumulation is required.A proteomic survey of the response of plants to metal exposure is a step towards this understanding.The frd3-3 metal accumulating mutant of Arabidopsis thaliana and its nonaccumulating wildtype parental ecotype, Columbia, were grown hydroponically in growth chamber experiments and exposed to copper in the growth medium.The responses of the global and copper-targeted proteomes were examined both spatially and temporally.Exposure to copper caused a general increase in protein abundance, however, a prolonged exposure to copper that approached toxicity caused a decrease in protein abundance.The protein species differed between the roots of the two genotypes, with more defense-and stress-related proteins, and fewer transport and storage proteins identified in the mutant when compared to the wildtype.Proteomic evidence suggests that in the mutant the uptake and transport of copper ions to the aerial tissues is regulated.The protein expression patterns over time demonstrate a constitutive expression of defense-and stress-related proteins in the mutant, whereas the wildtype expression was one of induction.The constitutive expression of key defense proteins suggests a "state-ofreadiness" for metal exposure in the mutant.The plant response to reactive oxygen species, as a consequence of copper exposure, is important in the overall metal accumulation mechanism.A suppression of the oxidative burst produced upon exposure to heavy metals is suggested by the proteomic evidence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».