Evidence for linkage of Type 1 Diabetes (T1D) resistance and upregulation of eotaxin (CCL11) in pancreatic beta cells to a chromosome 12 locus in the Biobreeding rat (49.2)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The Biobreeding (BB) rat spontaneously develops autoimmune Type 1 Diabetes (T1D). We tested the hypothesis that the recently reported upregulation of CCL11 in BB rat βcells prior to insulitis is genetically determined and linked to T1D. This time-dependent upregulation of CCL11 transcription was not observed in T1D resistant ACI rats. Therefore linkage analysis for T1D and pancreatic CCL11 was performed in a conditioned cross/intercross between BB and ACI rats where all animals (n=574) carried T1D susceptibility alleles at the two known BB rat T1D genes. Eight T1D loci (chr 1, 2, 3, 2 in 6, 12, 14 and 17) were mapped establishing the polygenic nature of T1D in the BB rat and at three of these (chr 1, 3 and 12) the BB allele confers T1D resistance. Strikingly, upregulation of pancreatic CCL11 transcription mapped to the T1D locus on chromosome 12 (LOD=3.65) and the peak of linkage (D12rat51) was the same for the two traits. At D12rat51, homozygosity for the BB allele confers high levels of pancreatic eotaxin expression and T1D resistance, raising the possibility that upregulation of the Th2 chemokine CCL11 in the target tissue of the anti-pancreatic autoimmune process is protective. Research supported by Genome Canada and Banting and Best Diabetes Centre.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».