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Enregistrement W1041373677 · doi:10.1016/j.gpb.2015.03.001

Modulation of Gene Expression in Key Survival Pathways During Daily Torpor in the Gray Mouse Lemur, <i>Microcebus Murinus</i>

2015· article· en· W1041373677 sur OpenAlexafffund
Kyle K. Biggar, Cheng‐Wei Wu, Shannon N. Tessier, Jing Zhang, Fabien Pifferi, Martine Perret, Kenneth B. Storey

Notice bibliographique

RevueGenomics Proteomics & Bioinformatics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensRoyal Military College of CanadaCarleton UniversityWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésTorporLemurBiologyGene expressionHibernation (computing)Brown adipose tissueGround squirrelCLOCKRegulation of gene expressionGeneAdipose tissueEndocrinologyGeneticsPrimateEcologyThermoregulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A variety of mammals employ torpor as an energy-saving strategy in environments of marginal or severe stress either on a daily basis during their inactive period or on a seasonal basis during prolonged multi-day hibernation. Recently, a few Madagascar lemur species have been identified as the only primates that exhibit torpor; one of these is the gray mouse lemur (Microcebus murinus). To explore the regulatory mechanisms that underlie daily torpor in a primate, we analyzed the expression of 28 selected genes that represent crucial survival pathways known to be involved in squirrel and bat hibernation. Array-based real-time PCR was used to compare gene expression in control (aroused) versus torpid lemurs in five tissues including the liver, kidney, skeletal muscle, heart, and brown adipose tissue. Significant differences in gene expression during torpor were revealed among genes involved in glycolysis, fatty acid metabolism, antioxidant defense, apoptosis, hypoxia signaling, and protein protection. The results showed upregulation of select genes primarily in liver and brown adipose tissue. For instance, both tissues showed elevated gene expression of peroxisome proliferator activated receptor gamma (ppargc), ferritin (fth1), and protein chaperones during torpor. Overall, the data show that the expression of only a few genes changed during lemur daily torpor, as compared with the broader expression changes reported for hibernation in ground squirrels. These results provide an indication that the alterations in gene expression required for torpor in lemurs are not as extensive as those needed for winter hibernation in squirrel models. However, identification of crucial genes with altered expression that support lemur torpor provides key targets to be explored and manipulated toward a goal of translational applications of inducible torpor as a treatment option in human biomedicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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