Biochemical and Transcriptomic Effects of Herring Gull Egg Extracts from Variably Contaminated Colonies of the Laurentian Great Lakes in Chicken Hepatocytes
Notice bibliographique
Résumé
Determining the effects of complex mixtures of environmental contaminants poses many challenges within the field of ecotoxicology. In this study, graded concentrations of herring gull egg extracts, collected from five Great Lakes breeding colonies with variable burdens of organohalogen contaminants (OHCs), were administered to chicken embryonic hepatocytes to determine effects on 7-ethoxyresorufin-O-deethylase (EROD) activity, porphyrin accumulation, and mRNA expression. EROD activity and porphyrin accumulation permitted the ranking of colonies based on the efficacy of eliciting an aryl hydrocarbon receptor-mediated response. An avian ToxChip polymerase chain reaction (PCR) array provided more exhaustive coverage in terms of potential toxicity pathways being affected, including xenobiotic and lipid metabolism and the thyroid hormone pathway. Herring gull eggs from Channel Shelter Island (CHSH, Lake Huron) and Gull Island (GULL, Lake Michigan) had among the highest OHC burdens, and extracts elicited a biochemical and transcriptomic response greater than that of extracts from the other three, less polluted colonies. For example, EROD EC50 values and porphyrin ECthreshold values were lower for CHSH and GULL extracts than for the other colonies. Extracts from CHSH and GULL altered 15 and 13 of 27 genes on the PCR array compared to no more than eight genes for the less contaminated sites. The combination of a well-established avian in vitro assay, two well-characterized biochemical assays, and the avian ToxChip PCR array permitted the geographical discrimination of variably contaminated herring gull eggs from the Great Lakes. Such high-throughput assays show potential promise as cost-effective tools for determining toxic potencies of complex mixtures in the environment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».