MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W105908140 · doi:10.1177/070674371405900202

From Pharmacogenetics to Pharmacogenomics: The Way toward the Personalization of Antidepressant Treatment

2014· review· en· W105908140 sur OpenAlexvenueno aff
Chiara Fabbri, Stefano Porcelli, Alessandro Serretti

Notice bibliographique

RevueThe Canadian Journal of Psychiatry · 2014
Typereview
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurotransmitter Receptor Influence on Behavior
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenome-wide association studyPharmacogeneticsPharmacogenomicsMajor depressive disorderAntidepressantEndophenotypeGenetic associationSerotonin transporterMedicinePsychiatryPersonalized medicineMEDLINEBioinformaticsPsychologyGeneticsPharmacologySingle-nucleotide polymorphismBiologyMoodGenotypeGeneCognitionAnxiety

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Major depressive disorder is the most common psychiatric disorder, worldwide, yet response and remission rates are still unsatisfactory. The identification of genetic predictors of antidepressant (AD) response could provide a promising opportunity to improve current AD efficacy through the personalization of treatment. The major steps and findings along this path are reviewed together with their clinical implications and limitations. METHOD: We systematically reviewed the literature through MEDLINE and Embase database searches, using any word combination of "antidepressant," "gene," "polymorphism," "pharmacogenetics," "genome-wide association study," "GWAS," "response," and "adverse drug reactions." Experimental works and reviews published until March 2012 were collected and compared. RESULTS: Numerous genes pertaining to several functional systems were associated with AD response. The more robust findings were found for the following genes: solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 4; serotonin receptor 1A and 2A; brain-derived neurotrophic factor; and catechol-O-methyltransferase. Genome-wide association studies (GWASs) provided many top markers, even if none of them reached genome-wide significance. CONCLUSIONS: AD pharmacogenetics have not produced any knowledge applicable to routine clinical practice yet, as results were mainly inconsistent across studies. Despite this, the rising awareness about methodological deficits of past studies could allow for the identication of more suitable strategies, such as the integration of the GWAS approach with the candidate gene approach, and innovative methodologies, such as pathway analysis and study of depressive endophenotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,980
Score d'incertitude au seuil0,829

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Canadian Journal of PsychiatryMême sujetNeurotransmitter Receptor Influence on BehaviorTravaux en français237 207