MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W1119702504 · doi:10.1096/fasebj.29.1_supplement.797.6

Generation and Utilization of Human Induced Pluripotent Stem Cells (iPS) from Primary Endothelial Cells for Studying Endothelial Gene Regulation

2015· article· en· W1119702504 sur OpenAlexaff
Maryam Nakhaei‐Nejad, Allan G. Murray, Nadia Jahroudi

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInduced pluripotent stem cellEmbryoid bodyBiologyCell biologyEndothelial stem cellPhenotypeTranscription factorEmbryonic stem cellMolecular biologyGeneGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mechanism(s) that establishes endothelial cells (EC) phenotype is not known. We aimed to study endothelial gene regulation by generating induced pluripotent stem cells (iPS) from human umbilical vein EC (HUVEC) and differentiating the resulting iPS back into EC. This model provides a system with a homogenous genetic background to explore how EC phenotype is revoked (HUVEC to iPS), and reestablished (iPS to EC). iPS colonies were generated using originally reported transcription factors. Quantitative RT-PCR, immunofluorescence and microarray analysis were used to characterize iPS and cell lineages derived from iPS. Pluripotency of the iPS were demonstrated by generation of embryoid bodies (EB) and detection of the three germ layer markers, as well as direct differentiation to functional specific cell types (including neurons, cardiomyocytes, and EC). We examined the mechanism of activation and repression of a highly EC-specific gene, von Willebrand factor (VWF), in HUVEC, iPS, EB and iPS that was differentiated into EC (EC-diff). We explored whether the expression pattern of transcription factors that regulate VWF are associated with establishment of EC phenotype. The expression levels of both VWF activators and repressors are reduced in iPS and EB but detected to similar levels in HUVEC and EC-diff, suggesting a more prominent role for activators in establishing EC gene activation and consequently EC phenotype. This system provides an opportunity for exploring endothelial gene regulation and consequently enables us to develop new therapeutic approaches for vascular diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetPluripotent Stem Cells Research→Travaux en français237 207→