Generation and Utilization of Human Induced Pluripotent Stem Cells (iPS) from Primary Endothelial Cells for Studying Endothelial Gene Regulation
Notice bibliographique
Résumé
The mechanism(s) that establishes endothelial cells (EC) phenotype is not known. We aimed to study endothelial gene regulation by generating induced pluripotent stem cells (iPS) from human umbilical vein EC (HUVEC) and differentiating the resulting iPS back into EC. This model provides a system with a homogenous genetic background to explore how EC phenotype is revoked (HUVEC to iPS), and reestablished (iPS to EC). iPS colonies were generated using originally reported transcription factors. Quantitative RT-PCR, immunofluorescence and microarray analysis were used to characterize iPS and cell lineages derived from iPS. Pluripotency of the iPS were demonstrated by generation of embryoid bodies (EB) and detection of the three germ layer markers, as well as direct differentiation to functional specific cell types (including neurons, cardiomyocytes, and EC). We examined the mechanism of activation and repression of a highly EC-specific gene, von Willebrand factor (VWF), in HUVEC, iPS, EB and iPS that was differentiated into EC (EC-diff). We explored whether the expression pattern of transcription factors that regulate VWF are associated with establishment of EC phenotype. The expression levels of both VWF activators and repressors are reduced in iPS and EB but detected to similar levels in HUVEC and EC-diff, suggesting a more prominent role for activators in establishing EC gene activation and consequently EC phenotype. This system provides an opportunity for exploring endothelial gene regulation and consequently enables us to develop new therapeutic approaches for vascular diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».