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Enregistrement W1142648200 · doi:10.1096/fasebj.29.1_supplement.863.3

Role of miR‐27a Mediated Regulation of VAV3 in Sepsis‐induced ARDS

2015· article· en· W1142648200 sur OpenAlexaff
Louis Zhou, Hajera Amatullah, Patricia Louise Gali, Zhou Dun, Yuexin Shan, Pingzhao Hu, Claúdia C. dos Santos

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésmicroRNAARDSIn vivoDownregulation and upregulationIn vitroBiologyWestern blotCancer researchCell migrationGeneMedicineLungInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mechanisms of the salutary effects of Mesenchymal stem cell (MSC) administration in sepsis-induced ARDS are unclear. We profiled mRNA and miRNA in septic lungs from MSC-treated vs non-treated mice (1) and identified differential expression of miR-27a and its putative target gene VAV3. Our objectives are to verify the regulation of VAV3 by miR-27 and determine an observable phenotype in vitro. Methods: In vitro – Human Pulmonary Microvascular Endothelial Cells (HPMECs) treated with 10ng/mL TNFα. In vivo – C57BL/6J instilled intratracheally with lipopolysaccharide (LPS) for 8 hours, and lungs are harvested. Differential expression of miR-27a and VAV3 at RNA and protein levels are measured by qPCR and Western blot. To verify regulation of VAV3 by miR-27a, we treat HPMECs with miR-27a specific inhibitor and mimic from QIAGEN. Scratch migration assay on HPMECs treated with miR-27a specific inhibitor and mimic, with and without TNFα. Results: VAV3 is down-regulated in both in vitro and in vivo, concomitant to increased levels of miR-27a. MiR-27a mimic demonstrates increased miR-27a expression and down-regulation of VAV3, and vice-versa upon treating with miR-27a inhibitor. In scratch migration assays, both TNFα and the miR-27a mimic are observed to decrease cellular migration, while the miR-27a inhibitor attenuates the decrease from TNFα stimulation. Conclusion In our models, miR-27a functions as a post-transcriptional regulator of VAV3. A decrease in VAV3 results in decreased cell migration, which may affect pulmonary wound healing and inflammation. (1) Mei, S. H. et al. AJRCCM, 2010. Research Funding: Grant # MOP-130331 to CCDS, Queen Elizabeth to LZ

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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