MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1148383869 · doi:10.1155/2009/518471

Antimicrobial Susceptibility of 6685 Organisms Isolated from Canadian Hospitals: CANWARD 2007

2009· article· en· W1148383869 sur OpenAlexafffundabout
George G. Zhanel, Mel DeCorby, Kim Nichol, Aleksandra Wierzbowski, Patricia J. Baudry, Franil Tailor, Philippe Lagacé‐Wiens, Andrew Walkty, Sergio Fanella, Oscar Larios, Michael R. Mulvey, Melissa McCracken, James A. Karlowsky

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Infectious Diseases and Medical Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensHealth CanadaUniversity of ManitobaHealth Sciences Centre
Organismes subventionnairesAstellas PharmaUniversity of AlbertaHealth CanadaBayerUniversity of ManitobaWyethPfizer CanadaMerck
Mots-clésTigecyclineBroth microdilutionLinezolidMicrobiologyCefepimeAntimicrobialDalbavancinDaptomycinMeropenemMedicineVancomycinPiperacillinErtapenemTazobactamMinimum inhibitory concentrationMethicillin-resistant Staphylococcus aureusAmikacinStaphylococcus aureusAntibiotic resistanceAntibioticsImipenemBiologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Antimicrobial resistance is a growing problem in North American hospitals as well as hospitals worldwide. OBJECTIVES: To assess the antimicrobial susceptibility patterns of commonly used agents against the 20 most common organisms isolated from Canadian hospitals. METHODS: In total, 7881 isolates were obtained between January 1, 2007, and December 31, 2007, from 12 hospitals across Canada as part of the Canadian Ward Surveillance Study (CANWARD 2007). Of these, 6685 isolates (20 most common organisms) obtained from bacteremic, urinary, respiratory and wound specimens underwent antimicrobial susceptibility testing. Susceptibility testing was assessed using the Clinical and Laboratory Standards Institute broth microdilution method. RESULTS: The most active (based upon minimum inhibitory concentration [MIC] data only) agents against methicillin‐resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and methicillin‐resistant Staphylococcus epidermidis (MRSE) were dalbavancin, daptomycin, linezolid, telavancin, tigecycline and vancomycin, with MICs required to inhibit the growth of 90% of organisms (MIC90) of 0.06 μg/mL and 0.06 μg/mL, 0.25 μg/mL and 0.25 μg/mL, 4 μg/mL and 1 μg/mL, 0.25 μg/mL and 0.25 μg/mL, 0.5 μg/mL and 0.25 μg/mL, and 1 μg/mL and 2 μg/mL, respectively. The most active agents against vancomycin‐resistant enterococci were daptomycin, linezolid and tigecycline with MIC of 2 μg/mL, 4 μg/mL and 0.12 μg/mL, respectively. The most active agents against Escherichia coli were amikacin, cefepime, ertapenem, meropenem, piperacillin‐tazobactam and tigecycline with MIC of 4 μg/mL, 2 μg/mL, 0.06 μg/mL or less, 0.12 μg/mL or less, 4 μg/mL and 1 μg/mL, respectively. The most active agents against extendedspectrum beta‐lactamase‐producing E coli were ertapenem, meropenem and tigecycline with MIC of 0.12 μg/mL or less, 0.12 μg/mL or less and 1 μg/mL, respectively. The most active agents against Pseudomonas aeruginosa were amikacin, cefepime, meropenem and piperacillin‐tazobactam with MIC of 32 μg/mL, 32 μg/mL, 8 μg/mL and 64 μg/mL, respectively. The most active agents against Stenotrophomonas maltophilia were tigecycline and trimethoprimsulfamethoxazole and levofloxacin with MIC of 8 μg/mL, 8 μg/mL and 8 μg/mL, respectively. The most active agents against Acinetobacter baumannii were amikacin, fluoroquinolones (eg, levofloxacin), meropenem, and tigecycline with MIC of 2 μg/mL or less, 1 μg/mL, 4 μg/mL and 2 μg/mL, respectively. CONCLUSIONS: The most active agents versus Gram‐positive cocci from Canadian hospitals were vancomycin, linezolid, daptomycin, tigecycline, dalbavancin and telavancin. The most active agents versus Gram‐negative bacilli from Canadian hospitals were amikacin, cefepime, ertapenem (not P aeruginosa), meropenem, piperacillintazobactam and tigecycline (not P aeruginosa). Colistin (polymyxin E) was very active against P aeruginosa and A baumannii.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,140

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2009
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of Infectious Diseases and Medical MicrobiologyMême sujetBacterial Identification and Susceptibility TestingTravaux en français237 207