Evolution of<i>Bordetella pertussis</i>and<i>Bordetella parapertussis</i>as Deduced from Comparative Genome Analyses
Notice bibliographique
Résumé
The genus Bordetella contains three widely studied species: Bordetella pertussis, B. parapertussis, and B. bronchiseptica. These gram-negative coccobacilli cause respiratory disease in humans and other mammals. The significance of insertion sequence (IS) elements to the evolution of B. pertussis and B. parapertussis is discussed. The bordetellae provide an opportunity to propose hypotheses to answer questions about speciation, host restriction, and differences in genotype that could account for virulence phenotypes. This was the rationale behind the Bordetella genome sequence project in which the genome sequences of representative strains of B. bronchiseptica, B. pertussis, and B. parapertussis were generated and analyzed. The evolution of any bacterium is shaped by the selection pressures faced by the organism. The evolution of species toward causing highly contagious infections, but with a low infectivity period, from a progenitor that is much less contagious but with a very prolonged infectious period is a recurrent theme in the evolution of human pathogens. A number of putative mutations are predicted to increase the level of expression of the pertussis toxin (PT) genes in B. pertussis compared to B. bronchiseptica or B. parapertussis, and this might have contributed to the change from chronic to acute infections during B. pertussis evolution. Analysis of B. parapertussis reveals that it appears to have evolved in the face of selection pressure against the expression of factors that might be recognized by existing host immunity, but in this case directed against B. pertussis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».