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Enregistrement W117007957 · doi:10.1096/fasebj.27.1_supplement.670.2

Decreased Nuclear Receptor Activity Mediates Down‐ Regulation of Drug Metabolizing Enzymes in Chronic Kidney Disease Through Epigenetic Modulation.

2013· article· en· W117007957 sur OpenAlexaff
Thomas J. Velenosi, David A. Feere, Gurjeev Sohi, Daniel B. Hardy, Ai Fu, Bradley L. Urquhart

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChromatin immunoprecipitationPregnane X receptorNuclear receptorHistoneEpigeneticsCYP3AInternal medicineEndocrinologyMessenger RNAKidney diseaseChemistryGene expressionBiologyPromoterMedicineCytochrome P450Transcription factorGeneBiochemistryMetabolism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective To determine the mechanism of hepatic drug metabolizing enzyme down‐regulation in chronic kidney disease (CKD). Methods Hepatic CYP3A1, CYP3A2 and CYP2C11 mRNA expression were determined in rats with surgically induced CKD. Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) was performed to determine nuclear receptor and epigenetic mediated differences in the promoter region of these enzymes. Results Hepatic CYP3A and CYP2C11 mRNA expression was significantly decreased in CKD rats compared to controls (P<0.05). RNA polymerase II binding to the CYP3A and CYP2C11 promoter regions was decreased in CKD rats (P<0.05). ChIP also revealed a decreased PXR binding to the CYP3A2 promoter in CKD rats (P<0.05). HNF4α binding to the CYP3A and CYP2C11 promoter regions was also decreased compared to controls (P<0.05). The decrease in PXR and HNF4α binding was concurrent with diminished histone 4 acetylation in the CYP3A2 promoter locus for nuclear receptor activation. Conclusions We demonstrate a novel mechanism of drug metabolizing enzyme regulation in CKD. Our results show that decreased CYP3A and CYP2C11 mRNA expression is secondary to decreased PXR and HNF4α binding as a result of histone modulation in CKD. This research is supported by the Natural Sciences and Engineering Research Council.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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