Notice bibliographique
Résumé
Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) was used to analyse 147 isolates collected in two regions of Quebec province (Estrie and Montreal) between March 1998 and Feb. 1999, to determine the utility of molecular strain typing for a population-based collection of Campylobacter jejuni and to compare directly the discriminatory power of SmaI and KpnI restriction digests. With a combination of epidemiological criteria including space and time plus molecular strain typing, 49% of isolates from Estrie and 39% of isolates from Montreal were identified as belonging to a putative cluster. For 41% of the cases, sources were either missing or explicitly unknown; the remaining sources were subject to recall bias. Thus, the evaluation of sporadic cases of campylobacter enteritis by descriptive clinical investigation alone is neither sensitive nor reliable for identifying sources of infection. In the PFGE analysis, KpnI digests provided appreciably greater discriminatory power than SmaI digests. When combining the PFGE analyses with basic epidemiological criteria, 30% of the putative SmaI clusters were inconsistent with the epidemiological criteria compared with 17% of the KpnI clusters. Among the 98 isolates assigned to clusters by SmaI, only 65% gave concordant results with KpnI. In contrast, among the 81 isolates assigned to clusters by KpnI, 92% gave concordant results with SmaI. Finally, clusters that were epidemiologically related to ingestion of raw milk and specific water sources correlated better with the typing results based on KpnI than SmaI. Thus, KpnI is the enzyme of choice for molecular epidemiology studies of C. jejuni. The combination of continuous epidemiological surveillance and molecular strain typing may be useful for identifying new sources and mechanisms of transmission for community-acquired C. jejuni infection andultimately for developing new approaches to prevention.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».