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Enregistrement W1185608525

Molecular RB1 gene detection of minimal residual disease in metastatic retinoblastoma

2006· article· en· W1185608525 sur OpenAlexaff
Helen S. L. Chan, Diane Rushlow, John Doyle, James A. Williams, Esteban Abella, Élise Héon, Brenda L. Gallie

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOcular Oncology and Treatments
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRetinoblastomaBone marrowPathologyNeuroblastomaEnucleationAlleleCancer researchMinimal residual diseaseMedicinePrimary tumorBiologyCancerGeneMetastasisInternal medicineGeneticsCell culture
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proc Amer Assoc Cancer Res, Volume 47, 2006 4349 Purpose: Cure of metastatic retinoblastoma (RB) depends on chemotherapy with or without radiation to first reduce the systemic and central nervous system tumor load, followed by marrow-ablative chemotherapy and marrow rescue with stem cell transplant. We propose that the search for RB1 mutant alleles may be useful for assessing the completeness of the remission at the molecular level. This also allows monitoring for the absence of contaminating tumor cells in the stem cells harvested prior to transplant. Method: We developed a highly sensitive allele-specific PCR assay, to detect RB1 mutant alleles in the tumor cells, which are not present in the normal cells, in two children with metastatic but non-germline RB. Child A, age 2.6 years, had tumor infiltrating the orbit and extending intracranially with tumor cells in the cerebrospinal fluid (CSF), 1.6 years after enucleation of one eye for unilateral RB. Child B, age 2.5 years, had tumor infiltrating soft tissues and bone at the base of the skull with bone marrow involvement, 0.5 years after enucleation of one eye for unilateral RB. Results: RB1 mutations of both recurrent tumors were first identified by sequence analysis. The tumor of Child A was homozygous for R251X, and the tumor of Child B was homozygous for R358X. The allele-specific PCR assay was then used to detect the tumor RB1 mutant alleles. Both children had no tumor RB1 mutant alleles detectable in the normal cells in their peripheral blood. In Child A, the assay resolution was adequate to detect the R251X mutation at as low as 1:12,800 dilution, but serial CSF samples during and after chemotherapy showed no detectable R251X mutant. In Child B, the R358X mutation could be detectable at the 1:500 dilution level in the initial bone marrow sample, but serial bone marrow samples during and after chemotherapy showed no detectable R358X mutant. The peripheral blood stem cells harvested from both children also did not show their specific RB1 mutant alleles. Absence of RB1 mutant signals in post-chemotherapy CSF or bone marrow samples and the harvested stem cells supported the suitability of both children proceeding to consolidation with autologous stem cell transplant aimed at curing their metastatic RB. Conclusion: Molecular assaying for the tumor-specific RB1 mutations is complementary to conventional cytological and immunohistochemical evaluations of RB involvement of the CSF and bone marrow. This novel diagnostic tool is very sensitive for assessing minimal residual disease, detecting extraocular RB tumor cells in numbers much lower than possible by conventional methods. Molecular management holds particular promise for evaluating the efficacy of systemic treatment strategies for metastatic RB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,402
Écart entre enseignants0,360 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
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