Transcription Regulation by the<i>Bacillus subtilis</i>Response Regulator Spo0A
Notice bibliographique
Résumé
The ultimate response to the stationary phase varies between species of bacteria, for example, in Bacillus subtilis continued starvation leads to the production of a dormant form, the bacterial endospore. The activity of Spo0A in modulating transcription is affected by its phosphorylation. The purpose of this review is to focus on the mechanism of transcription regulation by Spo0A. The sequencing of the spo0A gene identified that it encoded a member of the response regulator family of proteins. The DNA binding domain was able to repress in vitro transcription from abrBp and to activate transcription from the promoter for the spoIIG operon (spoIIGp) in vitro. Recent work on the gp4 protein of the B. subtilis phage φ29 provides an interesting comparison with Spo0ABD. The activation of Spo0A involves phosphorylation of the N terminus of the protein. Mutation of amino acid D56, the site of phosphorylation of Spo0A, demonstrated that it is essential for normal levels of sporulation and for in vitro phosphorylation of the protein by the phosphorelay. The transcription kinetics assays the authors carried out predicted that Spo0A-P stimulated the conversion of an unstable intermediate to one that could initiate RNA synthesis rapidly. The genetic experiments and the in vitro assays lead to the conclusion that the transcription activation functions of Spo0A lie in the C-terminal domain and that these functions are inhibited by the N-terminal domain. The transcription regulation properties of Spo0A are more diverse than have been demonstrated for other response regulators.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».