MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W1194094708 · doi:10.1096/fasebj.29.1_supplement.102.1

The Molecular Tool‐Kit of Viral Hemorrhagic Fevers

2015· article· en· W1194094708 sur OpenAlexaff
Erica Ollmann Saphire, Zachary A. Bornholdt, Marnie L. Fusco, Dafna M. Abelson, Takao Hashiguchi, Jeffrey Lee, Yoshihiro Kawaoka, John M. Dye, James E. Crowe

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVP40EbolavirusCell biologyViral life cycleRandom hexamerViral proteinBiologyVirusEndosomeEpitopeVirologyTSG101Viral matrix proteinEbola virusGeneAntibodyMolecular biologyViral replicationGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ebola and Marburg viruses cause hemorrhagic fever with up to 90% lethality, and their genomes encode just seven genes. The few gene products encoded, their “tool‐kit”, are leveraged into a greater array of functions, by remodeling or rearranging of the 3D protein structures. The surface glycoprotein adopts a massive, heavily glycosylated form on the viral surface, but is remodeled into a minimal receptor‐binding core once inside the endosome. As a result, binding of many potential antibodies is lost as their epitopes are stripped form the virus. Crystal structures of potently neutralizing antibodies, however, reveal how one remains bound and reaches into the cryptic receptor‐binding site. Others likely neutralize by locking the GP structure in place. Additional protein transformation takes place at the other end of the virus life cycle, assembly and budding of nascent virions. Through multiple crystal structures, biochemistry and cellular microscopy, we illustrated that the matrix protein VP40 rearranges into different structures, each with a distinct function required for the ebolavirus life cycle. A butterfly‐shaped VP40 dimer trafficks to the cellular membrane. A distinct, linear hexamer structure is critical for assembly and release of the virion. A third structure of VP40, an RNA‐binding ring, regulates viral transcription inside infected cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetViral Infections and Outbreaks Research→Travaux en français237 207→