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Enregistrement W1201954463

Ginsenosides, Glycosidases and the Ginseng-Pythium Interaction

2015· article· en· W1201954463 sur OpenAlexfundno aff
Dimitre A. Ivanov

Notice bibliographique

RevueScholarship@Western (Western University) · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGinseng Biological Effects and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésGinsengPythiumChemistryTraditional medicineBiologyBotanyMedicine
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ginsenosides, the triterpenoid saponins produced by American ginseng (Panax quinquefolius L.), have been extensively studied for their medicinal value, however, their function in the rhizosphere remains largely unknown. Like other saponins, ginsenosides possess mild fungitoxic activity toward some common ginseng pathogens. However, numerous oomycete root pathogens of ginseng, most notably Pythium irregulare Buisman, are able to partially deglycosylate the 20 (S)-protopanaxadiol ginsenosides Rb1, Rd and gypenoside XVII via extracellular glycosidases (ginsenosidases), leading to the formation of a common product, ginsenoside F2. In this thesis the potential role(s) of these extracellular ginsenosidases and the ginsenoside products they produce (ie. ginsenoside F2) in the ginseng-P. irregulare pathosystem are examined. Treatment of the roots of ginseng plants with a relatively high dose of ginsenosides results in a delay of infection by P. irregulare, as monitored in vivo by a non-invasive chlorophyll fluorescence imaging method adapted to track the progression of a root pathogen in perennial plants. Furthermore, there is a correlation between the virulence of P. irregulare on ginseng and ginsenosidase activity and the presence of ginsenosides may act as a trigger for the production of these specific ginsenosidases, although the mechanism regulating this is unknown. Previously it was hypothesized that ginsenoside F2 acts as the main chemoattractant/growth stimulator in P. irregulare, however, data obtained showed in vitro inhibition of P. irregulare growth caused by ginsenoside F2, which was overcome with time. This has cast doubt on the initial hypothesis however, it is possible that the inhibition in growth may be overcome through a physiological/structural change in P. irregulare signalled by exposure to ginsenoside F2 which may be related to signalling and increased pathogenicity. This suggests that ginsenosides may serve to alter the growth and metabolism of P. irregulare which may serve to facilitate infection. In conjunction with the above work, amino-acid sequence data of the purified ginsenosidases was used to clone and sequence a putative ß-glucosidase designated as PiGH1-x from P. irregulare which in silico analysis suggests may encode previously isolated ß-1,2 glycosidases from P. irregulare. This will allow for future studies of the molecular triggers that that could be involved in facilitating the infection of ginseng by P. irregulare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,236
Score d'incertitude au seuil0,587

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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