Protective role of phosphatidic acid in the cellular response to lysophosphatidylcholine analogues
Notice bibliographique
Résumé
The synthetic lysophosphatidylcholine (LPC) analogue edelfosine and the naturally occurring platelet activating factor (PAF) are structurally related lipids. Edelfosine is a potent antitumor drug, while PAF is a neurotoxic lipid that has been implicated in Alzheimer's disease. These LPC analogues are also toxic to budding yeast, which can be used as an excellent model system to investigate their mode of action. LPC analogues induce alterations in membrane organization, lipid metabolism and signaling in yeast. Phosphatidic acid (PA) produced by the activity of PLD alleviates sensitivity of yeast cells to PAF and edelfosine. PA is a key lipid signalling and precursor of all glycerolipids. Recent lipid analysis indicates that diacylglycerol (DAG) accumulates in cells treated with LPC analogues and this could contribute to their toxicity. In fact, sensitivity assays in yeast genetically manipulated to alter PA and DAG levels clearly support a protective role of PA in the response to these lipid drugs. Altogether, the evidence suggests that cells are able to sense altered PA: DAG ratios induced by these metabolically stable lipids. While DAG binding proteins have not been clearly identified in yeast, several yeast proteins recognize PA with high specificity. One such protein is the transcriptional repressor Opi1, which regulates expression of phospholipid biosynthetic genes through its interaction with PA. We provide evidence supporting a role of Opi1 in sensing the membrane changes induced by edelfosine, including i) altered sensitivity of cells lacking Opi1, ii) prevalent nuclear localization and iii) Opi1‐dependent UAS INO gene repression induced by edelfosine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».