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Enregistrement W1218006071 · doi:10.1096/fasebj.29.1_supplement.886.14

Determining the Role of Oxysterol Binding Protein‐Related Protein 4 (ORP4) in Cell Proliferation and Survival

2015· article· en· W1218006071 sur OpenAlexaff
Antonietta Pietrangelo, Mark Charman, Neale D. Ridgway

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCell biologyGene silencingBiologyCell cycleMAPK/ERK pathwaySmall hairpin RNACell cycle checkpointCell growthHeLaApoptosisPhosphorylationMolecular biologyCellBiochemistryGene knockdown

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oxysterol binding protein (OSBP) and related proteins (ORPs) constitute a 12-member family of mammalian lipid binding proteins with diverse cellular expression, localization and ligands. ORP4 is closely related to OSBP and expressed as short (ORP4S), medium (ORP4M) and long (ORP4L) isoforms as a result of alternate transcription start sites. ORP4 was initially discovered in disseminated tumor cells and considered a potential marker of metastasis. We recently showed that lentiviral short-hairpin RNA silencing of ORP4 induced cell-specific growth arrest or apoptosis. To determine how ORP4 promotes cell proliferation and survival, we identified relevant signaling pathways that are activated upon ORP4 silencing. In HeLa cells, ORP4 silencing was accompanied by elevated expression of p21 and phospho-p53 isoforms as well as cell cycle arrest but not apoptosis. ORP4 silencing also induced growth arrest in HEK 293 cells but triggered apoptosis in non-transformed rat intestinal epithelial cells. A potential role for ORP4L in genomic stability is indicated by its interaction with a component of the Mis18 complex required for centromere organization. Mass spectrometry was used to identify a MAPK phosphorylation site in the C-terminal lipid-binding domain of ORP4L. An ORP4L phospho-mimetic (serine-to-glutamate) MAPK site mutant expressed in HeLa cells was associated with an aggregated vimentin network, which was not observed with the corresponding serine-to-alanine mutant or wild-type ORP4L. These data suggest that ORP4L phosphorylation by MAPK enhances its interaction with the cytoskeleton and/or genomic regulators, ultimately affecting p21/p53-dependent control of cell cycle progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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