The unfolded protein response regulates MHC class I‐peptide presentation
Notice bibliographique
Résumé
Cell stress elicits the unfolded protein response (UPR). UPR regulates the two processes that control MHC I‐peptide (MHC I‐p) presentation: protein translation and degradation. We therefore asked whether and how the UPR might modify MHC I‐p presentation. We evaluated the impact of the UPR on global MHC I expression and on presentation of the SIINFEKL peptide. EL4 cells stably transfected with bicistronic vectors coding HEL‐SIINFEKL protein variants were stressed with pharmacological agents or exposed to physiologically relevant stress, such as glucose deprivation, for various time durations. UPR intensity was monitored by western blot and/or qRT‐PCR analysis of BiP, XBP‐1 and phosphorylation of eIF2alpha. Expression of Kb and of Kb‐SIINFEKL was assessed by flow cytometry with or without prior acid peptide elution. UPR decreased surface expression of MHC, but did not affect its mRNA. Consequently, presentation of SIINFEKL by H2‐Kb molecules was decreased in chemically or physiologically stressed cells. During the UPR, cells preferentially presented MHC I‐p derived from the ER as opposed to the cytosol. Also, generation of de novo Kb‐SIINFEKL complexes was less affected for ER‐ vs. cytosol‐derived SIINFEKL. Our results show that the UPR affects MHC I‐p presentation and that it differentially regulates expression of ER‐ vs. cytosol‐derived peptides. Supported by the NCIC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».