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Enregistrement W1251615755 · doi:10.1385/1-59745-167-3:331

In Vitro Assays of the Functions of Calnexin and Calreticulin, Lectin Chaperones of the Endoplasmic Reticulum

2006· review· en· W1251615755 sur OpenAlexaff
Breanna S. Ireland, Monika Niggemann, David B. Williams

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2006
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCalnexinCalreticulinEndoplasmic reticulumChaperone (clinical)GlycoproteinCell biologyBiochemistryGlycanLectinProtein foldingChemistryGlycosylationFoldaseBiologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Calnexin and calreticulin are molecular chaperones of the endoplasmic reticulum (ER) whose folding-promoting functions are directed predominantly toward aspargine-linked glycoproteins. This is a consequence of calnexin and calreticulin being lectins with specificity for the early oligosaccharide (OS)-processing intermediate, Glc1Man9GlcNAc2. In addition, they interact with non-native conformers of glycoprotein polypeptide chains to prevent aggregation and recruit the thiol oxidoreductase ERp57 to catalyze glycoprotein disulfide formation/isomerization. In vitro assays of these functions have contributed greatly to our understanding of how calnexin and calreticulin promote glycoprotein folding. This chapter describes the isolation of Glc1Man9GlcNAc2 OS, as well as the assay used to measure OS binding. Furthermore, details are provided of assays that detect ERp57 binding by calnexin and calreticulin, as well as the abilities of these chaperones to suppress the aggregation of non-native protein substrates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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