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Enregistrement W12727065 · doi:10.4238/2012.april.27.10

Short Communication DNA sequence variants in the carbonyl reductase 1 (cbr1) gene in seven breeds of Canis lupus familiaris

2012· article· en· W12727065 sur OpenAlexaboutno aff
Qiuying Cheng, Christopher K. Sanborn, Daniel C. Ferguson, Javier G. Blanco

Notice bibliographique

RevueGenetics and Molecular Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChemotherapy-induced cardiotoxicity and mitigation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyAnthracyclineUntranslated regionDaunorubicinThree prime untranslated regionGeneticsGeneMolecular biologyPharmacologyMessenger RNAChemotherapyCancerBreast cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The anticancer anthracyclines doxorubicin and daunorubicin are used to treat a variety of cancers in dogs. The therapeutic utility of anthracyclines is limited by cardiotoxicity in some cases. Synthesis of anthracycline alcohol metabolites by carbonyl reductase 1 (CBR1) is crucial for the pathogenesis of cardiotoxicity. We hypothesize that genetic polymorphisms in canine cbr1 contribute to the variable pharmacodynamics of anthracyclines in dogs. DNA sequence variants in canine cbr1 were investigated in DNA samples from dogs of seven breeds. Thirteen SNPs were detected in canine cbr1. A 10-bp deletion in the 5'-untranslated region (5'-UTR) was found in specimens from the Labrador Retriever, Beagle, Siberian Husky, and Boxer breeds. The 5'-UTR also included a polymorphic "hot spot" region immediately downstream of the 10-bp deletion. DNA sequence variants in the "hot spot region" ranged from 1 to 21 bp in length. Bioinformatics searches identified a cluster of three to six potential binding sites for the transcription factor Sp1 in the DNA segment containing both the "hot spot" region and the 10-bp deletion. This information provides a foundation to allow us to investigate whether DNA sequence variants in the 5'-UTR of canine cbr1 impact the pharmacodynamics of anticancer anthracyclines in dogs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,081
Score d'incertitude au seuil0,276

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,086
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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