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Enregistrement W1278770815 · doi:10.1128/9781555815806.ch12

Periplasmic Events in the Assembly of Bacterial Lipopolysaccharides

2014· book-chapter· en· W1278770815 sur OpenAlex
Chris Whitfield, Emilisa Frirdich, Anne N. Reid

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueASM Press eBooks · 2014
Typebook-chapter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeriplasmic spaceMicrobiologyComputational biologyBiologyBiochemistryEscherichia coliGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This chapter provides an overview of the assembly pathways for lipopolysaccharide (LPS) molecules, with particular emphasis on reactions and components occurring in the periplasm. Species-specific variations on the generally conserved theme are now being identified. In the current working model, it is proposed that lipid A core binds to MsbA and the polar parts of the exported molecule enter the lumen of the transporter. WecA is an integral membrane protein that forms the undecaprenyl pyrophosphoryl-GlcNAc. The premise for the periplasmic location of the glucosylation reaction is based on studies with Salmonella that first showed undecaprenyl pyrophosphate-linked intermediates provide the acceptor for glucosylation. O-Acetyltransferases also modify O-polysaccharides. Well-documented examples include OafA, which confers O:5 specificity in Salmonella Oac encoded by the Shigella seroconverting bacteriophage SF6 and the O-acetyltransferase carried by Pseudomonas aeruginosa bacteriophage D3. The WbdD-mediated chain termination reactions establish modal regulation in participation with the ABC transporter because the export process is coupled to chain termination. Synthases are processive glycosyltransferases that have the capacity to synthesize polymers within one or more linkages. It has been shown that peptidoglycan is also distributed in a helical arrangement along the side walls of Escherichia coli and it will be interesting to see whether the events are coupled and whether the emerging bacterial cytoskeletal components play any role in dictating the sites of LPS insertion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,607
Score d'incertitude au seuil0,991

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle