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Enregistrement W129302041 · doi:10.2307/25065732

Autopolyploidy in angiosperms: Have we grossly underestimated the number of species?

2007· paratext· en· W129302041 sur OpenAlexaff
Pamela S. Soltis, Douglas W. Schemske, James F. Hancock, John N. Thompson, Brian C. Husband, Walter S. Judd

Notice bibliographique

RevueTaxon · 2007
Typeparatext
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Taxonomy and Phylogenetics
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPloidyReproductive isolationEvolutionary biologyGenetic algorithmSpecies complexEcologyZoologyPhylogenetic treeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many species comprise multiple cytotypes that represent autopolyploids, or presumed autopolyploids, of the basic diploid cytotype. However, rarely has an autopolyploid been formally named and considered to represent a species distinct from its diploid progenitor (Zea diploperennis and Z. perennis represent a rare example). The major reasons why autopolyploids have not been named as distinct species are: (1) tradition of including multiple cytotypes in a single named species; and (2) tradition and convenience of adhering to a broad morphology-based taxonomic (or phenetic) species concept. As a result, plant biologists have underrepresented the distinct biological entities that actually exist in nature. Although it may seem practical to include morphologically highly similar cytotypes in one species, this practice obscures insights into evolution and speciation and hinders conservation. However, we do not suggest that all cytotypes should be named; each case must be carefully considered. A number of species comprising multiple cytotypes have been thoroughly investigated. Drawing on the literature, as well as our own experience with several autopolyploids (Tolmiea menziesii, Galax urceolata, Chamerion angustifolium, Heuchera grossulariifolia, Vaccinium corymbosum), we reassess the traditional view of plant autopolyploids as mere cytotypes. When considered carefully, many unnamed autopolyploids fulfill the requirements of multiple species concepts, including the biological, taxonomic, diagnosability, apomorphic, and evolutionary species concepts. Compared to the diploid parent, the autopolyploids noted above possess distinct geographic ranges, can be distinguished morphologically, and are largely reproductively isolated (via a diversity of mechanisms including reproductive and ecological isolation). These five autopolyploids (and probably many others) represent distinct evolutionary lineages; we therefore suggest that they be considered distinct species and also provide a system for naming them.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,044

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0020,007
Communication savante0,0040,012
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations456
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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