MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W130424176 · doi:10.1007/978-1-61779-120-8_20

CFTR Folding Consortium: Methods Available for Studies of CFTR Folding and Correction

2011· article· en· W130424176 sur OpenAlexaff
Kathryn W. Peters, Tsukasa Okiyoneda, William E. Balch, Ineke Braakman, Jeffrey L. Brodsky, William B. Guggino, Christopher M. Penland, Harvey B. Pollard, Eric J. Sorscher, William R. Skach, Philip Thomas, Gergely L. Lukács, Raymond A. Frizzell

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésCystic fibrosisProtein engineeringMutantProtein foldingComputational biologyChemistryCell biologyBiologyBiochemistryEnzymeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The CFTR Folding Consortium (CFC) was formed in 2004 under the auspices of the Cystic Fibrosis Foundation and its drug discovery and development affiliate, CFF Therapeutics. A primary goal of the CFC is the development and distribution of reagents and assay methods designed to better understand the mechanistic basis of mutant CFTR misfolding and to identify targets whose manipulation may correct CFTR folding defects. As such, reagents available from the CFC primarily target wild-type CFTR NBD1 and its common variant, F508del, and they include antibodies, cell lines, constructs, and proteins. These reagents are summarized here, and two protocols are described for the detection of cell surface CFTR: (a) an assay of the density of expressed HA-tagged CFTR by ELISA and (b) the generation and use of an antibody to CFTR's first extracellular loop for the detection of endogenous CFTR. Finally, we highlight a systematic collection of assays, the CFC Roadmap, which is being used to assess the cellular locus and mechanism of mutant CFTR correction. The Roadmap queries CFTR structure-function relations at levels ranging from purified protein to well-differentiated human airway primary cultures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,103
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,152
Tête enseignante GPT0,517
Écart entre enseignants0,366 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMethods in molecular biologyMême sujetCystic Fibrosis Research AdvancesTravaux en français237 207