Comparative Proteomic Label-Free Analysis of <i>Campylobacter jejuni</i> NCTC 11168 Cultured with Porcine Mucin
Notice bibliographique
Résumé
Campylobacter jejuni is a major gastrointestinal pathogen in humans. Poultry is a primary reservoir for C. jejuni, and C. jejuni appears to be highly adapted to the gastrointestinal tracts of avian species. We determined the protein expression profiles of C. jejuni NCTC 11168 cultured in medium containing porcine mucin. Differentially expressed proteins in the presence and absence of porcine mucin were identified using the label-free method. We identified 52 proteins with expression that was either upregulated (32 proteins) or downregulated (20 proteins) by porcine mucin. These proteins are involved in diverse cellular functions, such as motility, cell wall synthesis, iron transport, energy production, and amino acid metabolism. In particular, the upregulated proteins were involved in chemotaxis (CheV and CetA), motility (FlaA), colonization and adherence (CadF, FrdA, CfrA, MapA, and HydA), and stress tolerance (TrxB and ClpB). These results suggest that C. jejuni changes its protein expression in response to porcine mucin and that this change in expression may contribute to host adaptation of C. jejuni NCTC 11168.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».