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Enregistrement W141710489 · doi:10.1093/jaoac/90.5.1456

Overaccumulation of Higher Polyamines in Ripening Transgenic Tomato Fruit Revives Metabolic Memory, Upregulates Anabolism-Related Genes, and Positively Impacts Nutritional Quality

2007· article· en· W141710489 sur OpenAlexaff
Autar K. Mattoo, Sang Ho Chung, Ravinder K. Goyal, Tahira Fatima, Theophanes Solomos, Alka Srivastava, Avtar K. Handa

Notice bibliographique

RevueJournal of AOAC International · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePolyamine Metabolism and Applications
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiochemistryRipeningBiologyBiosynthesisMetabolic pathwayPolyamineSpermineFlavonoid biosynthesisPutrescineGenetically modified tomatoTranscriptomeTransgeneMetabolismGeneGenetically modified cropsGene expressionFood science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vegetables and fruits are essential components of the human diet as they are sources of vitamins, minerals, and fiber and provide antioxidants that prevent chronic diseases. Our goal is to improve durable nutritional quality of tomato fruit. We developed transgenic tomatoes expressing yeast S-adenosylmethionine decarboxylase (ySAMdc) gene driven by a fruit-specific E8 promoter to investigate the role of polyamines in fruit metabolism. Stable integration of E8-ySAMdc chimeric gene in tomato genome led to ripening-specific accumulation of polyamines, spermidine (Spd) and spermine (Spm), which in turn affected higher accumulation of glutamine, asparagine, and organic acids in the red fruit with significant decrease in the contents of valine, aspartate, sucrose, and glucose. The metabolite profiling analysis suggests that Spd/Spm are perceived as "signaling" organic-N metabolites by the fruit cells, resulting in the stimulation of carbon sequestration; enhanced synthesis of biomolecules; increased acid to sugar ratio, a good attribute for the fruit flavor; and in the accumulation of another "vital amine," choline, which is an essential micronutrient for brain development. A limited transcriptome analysis of the transgenic fruit that accumulate higher polyamines revealed a large number of differentially expressed genes, about 55% of which represented discrete functional categories, and the remaining 45% were novel, unknown, or unclassified: amino acid biosynthesis, carotenoid biosynthesis, cell wall metabolism, chaperone family, flavonoid biosynthesis, fruit ripening, isoprenoid biosynthesis, polyamine biosynthesis, signal transduction, stress/defense-related, transcription, translation, and vacuolar function. There was a good correspondence between some gene transcripts and their protein products, but not in the case of the tonoplast intrinsic protein, which showed post-transcriptional regulation. Higher metabolic activity of the transgenic fruit is reflected in higher respiratory activity, and upregulation of chaperones and mitochondrial cytochrome oxidase transcripts compared to the control. These transgenic plants are a new resource to understand the role of Spd/Spm in fruit biology. Transcriptome analysis and metabolic profiles of Spd/Spm accumulating, transgenic fruit suggest the presence of an intricate regulation and interconnection between certain metabolic pathways that are revived when Spd and Spm likely reach a certain threshold. Thus, polyamines act as antiapoptotic regulatory molecules and are able to revive metabolic memory in the tomato fruit.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,696
Score d'incertitude au seuil0,507

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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