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Enregistrement W1419899330 · doi:10.1096/fasebj.29.1_supplement.915.2

Functional Studies of the Putative Organic Cation Transporter SLC22A23

2015· article· en· W1419899330 sur OpenAlexaffabout
Nazia Chaity

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSolute carrier familyGreen fluorescent proteinGeneTransporterBiologyTransfectionSubcellular localizationGene expressionInflammatory bowel diseaseMembrane proteinHEK 293 cellsTransport proteinCell biologyGeneticsDiseaseMedicinePathologyMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction SLC22A23 (Solute Carrier 22 family 23) is an orphan gene that encodes for a putative organic cation membrane transporter protein. The gene has been repeatedly associated to inflammatory bowel disease however; the gene structure in human and its function is still uncharacterized. Inflammatory bowel disease (IBD) is a chronic disease that is steadily increasing worldwide with the highest prevalence in Canada. Objectives The proposed research aims to determine the tissue expression and characterize the subcellular location of the SLC22A23 protein, in mammalian cells. Methods Human SLC22A23 has been subcloned by Gateway® Technology and tagged with green fluorescent protein (GFP) and transfected in three cell lines‐ CHO, MDCK and Caco‐2. Membrane localization of SLC22A23 has been performed using confocal fluorescence microscopy. And to determine the tissue expression Real‐Time polymerase chain reaction has been used. Results Human SLC22A23 protein is located in the cell membrane and is abundantly expressed in various tissues in human body with high expression in brain, kidney and intestine. Conclusion The characterization of the SLC22A23 gene will provide the basis to determine which genetic variation is causative in the development of IBD in future studies. The correct sub‐cellular location will confirm that the human SLC22A23 is a membrane transporter protein (as known from the rat orthologous). Further functional studies of this gene will explicate the mechanism in the development of IBD and will contribute to the understanding which metabolite/nutrient imbalance plays a role in the development of IBD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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