Functional Studies of the Putative Organic Cation Transporter SLC22A23
Notice bibliographique
Résumé
Introduction SLC22A23 (Solute Carrier 22 family 23) is an orphan gene that encodes for a putative organic cation membrane transporter protein. The gene has been repeatedly associated to inflammatory bowel disease however; the gene structure in human and its function is still uncharacterized. Inflammatory bowel disease (IBD) is a chronic disease that is steadily increasing worldwide with the highest prevalence in Canada. Objectives The proposed research aims to determine the tissue expression and characterize the subcellular location of the SLC22A23 protein, in mammalian cells. Methods Human SLC22A23 has been subcloned by Gateway® Technology and tagged with green fluorescent protein (GFP) and transfected in three cell lines‐ CHO, MDCK and Caco‐2. Membrane localization of SLC22A23 has been performed using confocal fluorescence microscopy. And to determine the tissue expression Real‐Time polymerase chain reaction has been used. Results Human SLC22A23 protein is located in the cell membrane and is abundantly expressed in various tissues in human body with high expression in brain, kidney and intestine. Conclusion The characterization of the SLC22A23 gene will provide the basis to determine which genetic variation is causative in the development of IBD in future studies. The correct sub‐cellular location will confirm that the human SLC22A23 is a membrane transporter protein (as known from the rat orthologous). Further functional studies of this gene will explicate the mechanism in the development of IBD and will contribute to the understanding which metabolite/nutrient imbalance plays a role in the development of IBD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».