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Enregistrement W1425014140 · doi:10.25560/24168

The impact of fossils on arthropod phylogeny

2013· dissertation· en· W1425014140 sur OpenAlexaboutno aff
David Legg

Notice bibliographique

RevueSpiral (Imperial College London) · 2013
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFossil Insects in Amber
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésArthropodPhylogeneticsBiologyEvolutionary biologyPaleontologyGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The arthropods are the most diverse, abundant and ubiquitous phylum on Earth. Five main extant groups (subphyla) can be recognized: Pycnogonida, Euchelicerata, Myriapoda, Hexapoda, and Crustacea. Each group displays a distinctive body plan and a suite of autapomorphies that makes determining their interrelationships difficult. Although a variety of hypotheses have been proposed regarding their interrelationships, just three have frequently been recovered in recent phylogenetic analyses. Rather than representing incongruent topologies these hypotheses represent variations of the position of the root on the same parent topology. The long histories of the major arthropod subclades, which had begun to diverge by, at least, the early Cambrian, means that long-branch artefacts are highly probable. To alleviate potential long-branch attraction and provide a more accurate placement of the root, 214 fossil taxa were coded into an extensive phylogenetic data set of 753 discrete characters, which also includes 95 extant panarthropods and two cycloneuralian outgroups. Preference was given to those fossil taxa thought to occur during the cladogenesis of the major arthropod clades, i.e. the lower and middle Cambrian. An extensive study of material from the middle Cambrian Burgess Shale Formation and the coeval Stephen Formation in British Columbia (Canada) was undertaken. This study focussed primarily on taxa thought to represent ‘upper stem-group euarthropods’, namely bivalved arthropods and megacheirans (‘great-appendage’ arthropods), as they will have the greatest utility in polarizing relationships within the arthropod crown-group [= Euarthropoda]. This study includes the description of three new genera and four new species: the bivalved arthropods Nereocaris exilis, N. briggsi, and Loricicaris spinocaudatus; and the megacheiran Kootenichela deppi; and a restudy selected material referred to the bivalved arthropod taxa Isoxys, Canadaspis perfecta, Odaraia alata and Perspicaris dictynna. Results of the phylogenetic analysis and additional perturbation tests confirm the utility of these taxa for polarizing relationships within Euarthropoda and reducing long-branch artefacts. For example, the hexapods were recovered within a paraphyletic Crustacea, a result anticipated by molecular phylogenetic analyses but until now elusive in morphological phylogenies. Perturbation tests indicate that close affinities of myriapods and hexapods, a result common in morphological analyses, is the result of a long-branch artefact caused by the convergent adaptation to a terrestrial habit, which is broken by the addition of fossil material. The phylogeny provides a detailed picture of character acquisition in the arthropod stem group.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,041
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,034

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,041
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0060,007
Études des sciences et des technologies0,0020,003
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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