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Enregistrement W142559897 · doi:10.1002/humu.9488

Mutational analysis of the<i>HGSNAT</i>gene in Italian patients with mucopolysaccharidosis IIIC (Sanfilippo C syndrome)

2007· article· en· W142559897 sur OpenAlexfundno aff
Anthony O. Fedele, Mirella Filocamo, Maja Di Rocco, Giovanna Sersale, Torben Lübke, Paola Di Natale, Maria Pia Cosma, Andrea Ballabio

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Genetics
Mots-clésBiologyFrameshift mutationMissense mutationMucopolysaccharidosisGeneticsNonsense mutationGeneMutationAlleleMolecular biologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mucopolysaccharidosis (MPS) describes any inherited lysosomal storage disorder resulting from an inability to catabolize glycosaminoglycans. MPS III (or Sanfilippo syndrome) is an autosomal recessive disease caused by a failure to degrade heparan sulphate. There are four subtypes of MPS III, each categorized by a deficiency in a specific enzyme involved in the heparan sulphate degradation pathway. The genes mutated in three of these (MPS IIIA, MPS IIIB, and MPS IIID) have been cloned for some time. However, only very recently has the gene for MPS IIIC (heparin acetyl CoA: alpha-glucosaminide N-acetyltransferase, or HGSNAT) been identified. Its product (previously termed transmembrane protein 76, or TMEM76) has little sequence similarity to other proteins of known function, although it is well conserved among all species. In this study, a group of MPS IIIC patients, who are mainly of Italian origin, have been clinically characterized. Furthermore, mutational analysis of the HGSNAT gene in these patients resulted in the identification of nine alleles, of which eight are novel. Three splice-site mutations, three frameshift deletions resulting in premature stop codons, one nonsense mutation, and two missense mutations were identified. The latter are of particular interest as they are located in regions which are predicted to be of functional significance. This research will aid in determining the molecular basis of HGSNAT protein function, and the mechanisms underlying MPS IIIC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,462

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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