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Enregistrement W1431861807 · doi:10.4238/2015.august.21.22

Differential expression of TLP, ERF1, and R2R3MYB in annual Medicago species under salinity conditions

2015· article· en· W1431861807 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGenetics and Molecular Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesShahrekord UniversityIran National Science FoundationNational Science Foundation
Mots-clésMedicago truncatulaSalinityMedicagoBiologyBotanyGene expressionGeneHorticultureGeneticsEcologySymbiosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The present study was conducted to evaluate the responses of three annual Medicago species (M. truncatula, M. laciniata, and M. polymorpha) to salinity. We analyzed publicly available microarray data in NCBI pertaining to salinity-response genes in M. truncatula. Our data search identified Tubby C2 (TLP) and ethylene responsive transcription factor 1 (ERF1) as genes that potentially respond to salinity. We evaluated morpho-physiological traits and the expression of the genes in three Medicago species that had been maintained under control and saline conditions. The analysis of morpho-physiological traits showed that M. polymorpha and M. laciniata were more tolerant to salinity than M. truncatula, as they had lower reductions in biomass and dry root weight and lower increases in anthocyanin concentration. The saline conditions caused a significant increase (P < 0.01) in the expression of TLP in all Medicago species, but caused a significant decrease in the expression of ERF1. Considerable variation in anthocyanin concentrations was found among the three Medicago species. To investigate the cause of this variation, we examined the expression of R2R3MYB, a gene involved in the biosynthesis of anthocyanins. Our analysis showed that saline conditions induced high over-expression of R2R3MYB in all three Medicago spp. The high efficiency of the primer pairs used in qRT-PCR enabled us to compare the expression levels of each gene in the three species. We concluded that the more salt tolerant species showed higher expression of TLP and R2R3MYB under both control and salinity conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,445

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle