MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W1433972157 · doi:10.1371/journal.pone.0031369

Genome-Wide Association Study to Identify Common Variants Associated with Brachial Circumference: A Meta-Analysis of 14 Cohorts

2012· article· en· W1433972157 sur OpenAlexafffund
Vesna Boraska Perica, Aaron Day-Williams, Christopher S. Franklin, Katherine S. Elliott, Kalliope Panoutsopoulou, Ioanna Tachmazidou, Eva Albrecht, Stefania Bandinelli, Lawrence J. Beilin, Murielle Bochud, Gemma Cadby, Florian Ernst, David M. Evans, Caroline Hayward, Andrew A. Hicks, Jennifer E. Huffman, Cornelia Huth, Norman Klopp, Ivana Kolčić, Zoltán Kutalik, Debbie A. Lawlor, Arthur W. Musk, Marina Pehlić, Craig E. Pennell, John R. B. Perry, Annette Peters, Ozren Polašek, Beaté St Pourcain, Susan M. Ring, Erika Salvi, Sabine Schipf, Jan A. Staessen, Alexander Teumer, Nicholas J. Timpson, Véronique Vitart, Nicole M. Warrington, Hanieh Yaghootkar, Tatijana Zemunik, Lina Zgaga, Ping An, Verneri Anttila, Ingrid B. Borecki, Jostein Holmen, Ιωάννα Ντάλλα, Aarno Palotie, Kirsi H. Pietiläinen, Juho Wedenoja, Bendik S. Winsvold, George Dedoussis, Jaakko Kaprio, Michael A. Province, John‐Anker Zwart, Michel Burnier, Harry Campbell, Daniele Cusi, George Davey Smith, Timothy M. Frayling, Christian Gieger, Lyle J. Palmer, Peter P. Pramstaller, Igor Rudan, Henry Voelzke, H.‐Erich Wichmann, Alan F. Wright, Eleftheria Zeggini

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueShoulder Injury and Treatment
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingHelse Sør-Øst RHFMedical Research CouncilProvincia autonoma di Bolzano - Alto AdigeMinistero della SaluteNovo Nordisk FondenChinese Society of Clinical OncologySuomen KulttuurirahastoNational Health and Medical Research CouncilBundesministerium für Bildung und ForschungWomen and Infants Research FoundationRaine Medical Research FoundationGlaxoSmithKlineUniversity of BristolCurtin University of TechnologyEuropean CommissionNational Institutes of HealthSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungMünchner Zentrum für GesundheitswissenschaftenHealthwayUnity through Knowledge FundWellcome TrustCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesWellcomeNational Science Foundation
Mots-clésGenome-wide association studyMeta-analysisGenetic associationGeneticsCircumferenceBiologyMedicineSingle-nucleotide polymorphismGenotypeInternal medicineGeneMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Brachial circumference (BC), also known as upper arm or mid arm circumference, can be used as an indicator of muscle mass and fat tissue, which are distributed differently in men and women. Analysis of anthropometric measures of peripheral fat distribution such as BC could help in understanding the complex pathophysiology behind overweight and obesity. The purpose of this study is to identify genetic variants associated with BC through a large-scale genome-wide association scan (GWAS) meta-analysis. We used fixed-effects meta-analysis to synthesise summary results across 14 GWAS discovery and 4 replication cohorts comprising overall 22,376 individuals (12,031 women and 10,345 men) of European ancestry. Individual analyses were carried out for men, women, and combined across sexes using linear regression and an additive genetic model: adjusted for age and adjusted for age and BMI. We prioritised signals for follow-up in two-stages. We did not detect any signals reaching genome-wide significance. The FTO rs9939609 SNP showed nominal evidence for association (p<0.05) in the age-adjusted strata for men and across both sexes. In this first GWAS meta-analysis for BC to date, we have not identified any genome-wide significant signals and do not observe robust association of previously established obesity loci with BC. Large-scale collaborations will be necessary to achieve higher power to detect loci underlying BC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,051

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,015
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,026
Bibliométrie0,0040,006
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,124
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONE→Même sujetShoulder Injury and Treatment→Travaux en français237 207→