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Enregistrement W1439532443 · doi:10.1089/hgtb.2013.128

Improved Detection of Transgene and Nonviral Vectors in Blood

2013· article· en· W1439532443 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueHuman Gene Therapy Methods · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesWorld Anti-Doping AgencyAustralian Government
Mots-clésTransgeneBiologygenomic DNAGeneGenetic enhancementPlasmidGene deliveryComputational biologyVector (molecular biology)Molecular biologyTransgenesisGeneticsRecombinant DNAReproductive technology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vector biodistribution and clearance studies are essential in the development of gene transfer medicine. To provide reliable and accurate data, protocols for vector analysis must be optimized and validated. We addressed several parameters affecting the detection of gene therapy vectors in blood. Using an in vitro system based on plasmid DNA incorporating, as a transgene, complementary DNA for human erythropoietin gene, we developed and validated a suite of real-time PCR assays for the transgene splicing sites. The most sensitive assays detected the transgene present at 0.011% of the copy number of the endogenous erythropoietin gene in human genomic DNA at 100% specificity. Plasmid linearization incorporated with PCR resulted in an increase in assay sensitivity up to 4.5-fold without compromising analysis workflow. This allowed detection of five copies of transgene in a background of 0.4 μg of genomic DNA (or 0.0035% detectable transgene copies relevant to copies of the endogenous gene). Finally, desktop assessment of 18 DNA extraction protocols was undertaken and 5 kits were evaluated experimentally for extraction of nonviral vectors from blood. Three kits reliably detected 80 copies of the transgene in a milliliter of blood. Adoption of the described protocols will enable more reliable vector analysis in gene therapy and will assist in accurate interlaboratory comparison. The methodology will also facilitate detection of gene doping in sport, a potential new form of misuse of gene transfer technology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil0,419

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle