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Enregistrement W1454200793 · doi:10.1371/journal.pone.0131024

Potential Cross-Talk between Alternative and Classical NF-κB Pathways in Prostate Cancer Tissues as Measured by a Multi-Staining Immunofluorescence Co-Localization Assay

2015· article· en· W1454200793 sur OpenAlexafffund
Ingrid Labouba, Cécile Le Page, Laudine Communal, Torbjoern Kristessen, Xiaotian You, Benjamin Péant, Véronique Barrès, Philippe O. Gannon, Anne‐Marie Mes‐Masson, Fred Saad

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéTerry Fox Research InstituteCanadian Urological Oncology Group
Mots-clésProstate cancerImmunofluorescenceStainingCancer researchPathologyChemistryCancerBiologyMedicineAntibodyImmunologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: While the classical NF-κB/p65 pathway is known to be involved in prostate cancer progression and is associated with poor patient outcome, the role of the NF-κB /RelB alternative protein is not well defined. Here we analyzed the activation of both NF-κB pathways in prostate cancer tissues and correlate this activation with clinical features of the disease. METHODS: A multiple immunofluorescence technique was employed to concomitantly and quantitatively visualize the nuclear localization of p65 and RelB in 200 paraffin embedded samples. Epithelia were defined using appropriate fluorochrome markers and the resulting immunofluorescent signals were quantified with an automated scoring system. RESULTS: The nuclear frequency of p65 was found to be significantly increased in tumor tissues as compared with normal adjacent tissue, whereas the frequency for RelB was decreased (p < 0.001, Wilcoxon test). As previously reported, p65 nuclear frequency was associated with a risk of biochemical recurrence. Although, RelB nuclear frequency alone did not predict recurrence, the presence of activated RelB reduced the risk of recurrence associated with the activation of p65. CONCLUSION: For the first time p65/RelB co-distribution was assessed in prostate cancer tissues and suggested a negative crosstalk between the two NF-κB pathways in prostate cancer progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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