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Enregistrement W1462988911 · doi:10.1118/1.4925450

MO‐F‐CAMPUS‐J‐04: Tissue Segmentation‐Based MR Electron Density Mapping Method for MR‐Only Radiation Treatment Planning of Brain

2015· article· en· W1462988911 sur OpenAlexaff
Hengyong Yu, Y Lee, Mark Ruschin, Irene Karam, Arjun Sahgal

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVoxelHounsfield scaleSagittal planeSkullNuclear medicineCoronal planeHistogramSoft tissueIntensity (physics)SegmentationMagnetic resonance imagingMaterials sciencePhysicsMedicineAnatomyRadiologyComputer scienceComputed tomographyArtificial intelligenceOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose: Automatically derive electron density of tissues using MR images and generate a pseudo‐CT for MR‐only treatment planning of brain tumours. Methods: 20 stereotactic radiosurgery (SRS) patients’ T1‐weighted MR images and CT images were retrospectively acquired. First, a semi‐automated tissue segmentation algorithm was developed to differentiate tissues with similar MR intensities and large differences in electron densities. The method started with approximately 12 slices of manually contoured spatial regions containing sinuses and airways, then air, bone, brain, cerebrospinal fluid (CSF) and eyes were automatically segmented using edge detection and anatomical information including location, shape, tissue uniformity and relative intensity distribution. Next, soft tissues ‐ muscle and fat were segmented based on their relative intensity histogram. Finally, intensities of voxels in each segmented tissue were mapped into their electron density range to generate pseudo‐CT by linearly fitting their relative intensity histograms. Co‐registered CT was used as a ground truth. The bone segmentations of pseudo‐CT were compared with those of co‐registered CT obtained by using a 300HU threshold. The average distances between voxels on external edges of the skull of pseudo‐CT and CT in three axial, coronal and sagittal slices with the largest width of skull were calculated. The mean absolute electron density (in Hounsfield unit) difference of voxels in each segmented tissues was calculated. Results: The average of distances between voxels on external skull from pseudo‐CT and CT were 0.6±1.1mm (mean±1SD). The mean absolute electron density differences for bone, brain, CSF, muscle and fat are 78±114 HU, and 21±8 HU, 14±29 HU, 57±37 HU, and 31±63 HU, respectively. Conclusion: The semi‐automated MR electron density mapping technique was developed using T1‐weighted MR images. The generated pseudo‐CT is comparable to that of CT in terms of anatomical position of tissues and similarity of electron density assignment. This method can allow MR‐only treatment planning.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,372
Écart entre enseignants0,345 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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