Identification of Pathogenic T Cell Epitopes Near Cathepsin Cleavage Sites in Thyroglobulin
Notice bibliographique
Résumé
Experimental autoimmune thyroiditis, induced in mice after challenge with thyroglobulin (Tg), is known to be under the genetic control of the H2A(k) locus. Because cathepsins are known to influence proteolytic processing of Tg in vivo, we examined in this study whether putative H2A(k)-binding Tg epitopes, located near cathepsin cleavage sites within mouse Tg, have immunopathogenic properties. Cathepsin L, B, and D cleavage sites in mouse Tg were predicted based on homology with known cathepsin cleavage sites in rabbit Tg. We used an algorithm-based approach to identify H2A(k)-binding motifs within 20-aa residue segments adjacent to cathepsin cleavage sites, and five 12mer peptides encompassing these sequences were synthesized. Two of them, p2369 (aa 2369-2380) and p2439 (aa 2439-2450) were immunogenic, eliciting significant proliferative T cell responses using lymph node cells from peptide-primed mice and production of IL-2 and IFN-γ in recall assays in vitro. Both peptides induced experimental autoimmune thyroiditis upon direct challenge of CBA/J mice with peptide in CFA and by adoptive transfer of peptide-primed lymph node cells into naive recipient hosts, but neither peptide was characterized as dominant.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».