Evolutionary history and taxonomy of the <i>Cuscuta umbellata</i> complex (Convolvulaceae): Evidence of extensive hybridization from discordant nuclear and plastid phylogenies
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The Cuscuta umbellata complex is one of the 15 major clades recently circumscribed in C. subg.Grammica. Most of its members occur in North America and the Caribbean (C. desmouliniana, C. lacerata, C. leptantha, C. liliputana, C. odontolepis, C. polyanthemos, C. tuberculata, C. umbellata), but three species (C. acuta, C. membranacea, C. umbellata) grow in South America, and one (C. hyalina) is found as a native species in India, Pakistan and Eastern to South Africa. Basic morphology, scanning electron microscopy and sequence data from the nuclear internal transcribed spacer (ITS) and the plastid trnL‐F region were used to reconstruct the phylogeny, gain a better understanding of the evolutionary history, and determine species boundaries. Our results show that in its currently accepted delimitation C. umbellata is polyphyletic. Discordances between phylogenies derived from plastid and nuclear data strongly suggest that at least four independent hybridization events have occurred in the evolution of this species group, rendering relationships among its members more complex than previously thought. One of these reticulation events involves C. umbellata var. reflexa, a taxon that has been considered synonymous to C. umbellata var. umbellata in the last decades. This hybrid is morphologically intermediate but distinct from its putative parents, C. odontolepis or C. acuta on the maternal side, and C. umbellata (var. umbellata) on the paternal side, which supports its treatment as a new species, C. legitima. Cuscuta umbellata is further redefined to exclude C. umbellata var. dubia, which is merged into C. desmouliniana. A new classification is provided, together with an identification key, descriptions, illustrations, and geographical distributions for the twelve species of the clade.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».