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Enregistrement W1481389199 · doi:10.1136/amiajnl-2013-001636

Literature review of SNOMED CT use

2013· review· en· W1481389199 sur OpenAlexaff
Dennis Lee, Nicolette F. de Keizer, Francis Lau, Ronald Cornet

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Medical Informatics Association · 2013
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSNOMED CTSystematized Nomenclature of MedicineImplementationComputer scienceMedicineMEDLINEDomain (mathematical analysis)Information retrievalMedical physicsTerminologySoftware engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: The aim of this paper is to report on the use of the systematised nomenclature of medicine clinical terms (SNOMED CT) by providing an overview of published papers. METHODS: Published papers on SNOMED CT between 2001 and 2012 were identified using PubMed and Embase databases using the keywords 'systematised nomenclature of medicine' and 'SNOMED CT'. For each paper the following characteristics were retrieved: SNOMED CT focus category (ie, indeterminate, theoretical, pre-development/design, implementation and evaluation/commodity), usage category (eg, prospective content coverage, used to classify or code in a study), medical domain and country. RESULTS: Our search strategy identified 488 papers. A comparison between the papers published between 2001-6 and 2007-12 showed an increase in every SNOMED CT focus category. The number of papers classified as 'theoretical' increased from 46 to 78, 'pre-development/design' increased from 61 to 173 and 'implementation' increased from 10 to 34. Papers classified as 'evaluation/commodity' only started to appear from 2010. CONCLUSIONS: The majority of studies focused on 'theoretical' and 'pre-development/design'. This is still encouraging as SNOMED CT is being harmonized with other standardized terminologies and is being evaluated to determine the content coverage of local terms, which is usually one of the first steps towards adoption. Most implementations are not published in the scientific literature, requiring a look beyond the scientific literature to gain insights into SNOMED CT implementations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,014
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,070
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,077

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0140,070
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0430,034
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,005
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations177
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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