Sex-Biased Expression of Young Genes in <b><i>Silurana (Xenopus) tropicalis</i></b>
Notice bibliographique
Résumé
Sex-biased gene expression can evolve from sex-specific selection and is often associated with sex-linked genes. Gene duplication is a particularly effective mechanism for the generation of sex-biased genes, in which a new copy can help resolve intralocus sexual conflicts. This study assesses sex-biased gene expression in an amphibian with homomorphic ZW sex chromosomes, the Western clawed frog Silurana (Xenopus)tropicalis. Previous work has shown that the sex chromosomes in this species are mainly undifferentiated and pseudoautosomal. Consistent with ongoing recombination between the sex chromosomes, this study detected little evidence for the general sexualization of sex-linked regions. A subset of genes closely linked to the sex determining locus displays a tendency for male-biased expression and elevated rates of evolution relative to genes in other genomic locations. This may be a symptom of an early stage of sex chromosome differentiation driven by, for example, chromosomal degeneration or natural selection on genes in this portion of the Z chromosome. Alternatively, it could reflect variation between the sexes in allelic copy number coupled with a lack of dosage compensation. Irrespective of the genomic location, lineage-specific genes and recently duplicated genes had significantly high levels of sex-biased expression, offering insights into the early transcriptional differentiation of young genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».